随着联邦研究经费削减的财务影响日益显现，多个组织正警告此举对美国人健康的潜在威胁。
根据"资助见证"（Grant Witness）项目研究人员的数据，马萨诸塞州因美国国立卫生研究院（NIH）终止研究资助而损失超过13亿美元，成为受联邦削减影响最严重的州之一。自唐纳德·特朗普总统第二次就职以来，截至9月17日的数据显示，NIH已取消760项影响马萨诸塞州科学家及研究机构的资助项目。该项目整合政府数据库、新闻报道及受影响研究人员的经验证提交数据，实际损失可能高于当前统计。目前马萨诸塞州已有103项资助被责令恢复，这些项目未计入"资助见证"当前的损失估算。
该州拥有多所顶尖研究机构，包括正与特朗普政府就经费削减展开数月法律斗争的哈佛大学。最近，一名联邦法官裁定政府冻结令及经费取消决定"应予以撤销"。其他失去联邦研究经费的马萨诸塞州机构包括波士顿儿童医院、波士顿大学医学院和塔夫茨大学波士顿校区等。
纽约州是另一受重创的州，957项资助取消预计造成12.9亿美元损失。迄今纽约州1178项终止资助中已有221项被责令恢复。伊利诺伊州、加利福尼亚州、德克萨斯州、华盛顿州和罗得岛州也遭受严重冲击。而怀俄明州、西弗吉尼亚州和特拉华州受影响最小，资助取消未造成资金损失。
此前NIH年度预算近480亿美元，是全球最大的生物医学研究公共资助机构。在特朗普任内，联邦卫生机构开始撤销不符合其行政命令的科学研究经费，这些命令宣称美国政府仅承认两种性别，并要求废除多元化举措。据估计，特朗普最新政府任期内NIH已削减120亿美元研究经费。
资助终止引发多起诉讼。8月下旬，最高法院裁定特朗普政府可取消7.83亿美元与多元化议题相关的联邦研究经费，推翻了下级法院裁决，但同时禁止使用反多元化指导方针扣留未来资金。尽管最高法院批准了部分终止，其他法官已下令恢复部分削减。
截至发稿时，NIH尚未回应《生物技术领域》杂志关于终止研究资助总额或恢复资金是否已拨付的问询。
美国医学院协会（AAMC）9月18日报告指出，削减经费将危及美国人健康。该非营利组织代表医学教育、临床护理和生物医学研究领域人士。AAMC报告强调，虽然其他渠道可提供生物医学研究资金，但无任何组织能接近NIH的覆盖范围与支持力度——2025财年NIH为全美50个州2500多家机构的30多万名研究人员资助了经审核项目。2010至2019年间获得FDA批准的356种新药，其研发基础均源于NIH资助研究。
2024年诺贝尔生理学或医学奖共同得主维克多·安布罗斯博士指出："这里不可或缺的环节是纳税人与开展研究的大学之间的合作。"他表示早期研究获NIH支持，最终促成获奖突破，"NIH始终坚定支持基础科学，期待其可能以意想不到的方式产生回报"。
即便获得20亿美元创纪录捐赠的俄勒冈健康与科学大学奈特癌症研究所（KCI）也强调了联邦资金的重要性。该所帮助开发里程碑式抗癌药物格列卫的布莱恩·德鲁克博士表示，慈善捐赠永远无法替代纳税人集体资助的力量——NIH年度预算是KCI十年分期捐赠总额的24倍。《科学》杂志3月分析甚至表明，资助取消造成资金浪费，半途而废的项目实质上使已投入资金付诸东流。
美国医学院协会首席执行官戴维·斯科顿博士在9月18日报告中警告："经费中断已危及全国学术医疗系统和医学院的关键研究，延缓了癌症、糖尿病、阿尔茨海默病等多种疾病的治疗探索。"超过300名现任及前任NIH员工签署的6月《贝塞斯达宣言》指出，突然取消导致部分临床试验中止，威胁患者健康："NIH试验在不顾参与者安全的情况下被叫停，药物突然停用或参与者体内植入设备无人监测。"
尽管哈佛大学近期通过法律途径成功恢复联邦资金，其他院校则选择与政府达成协议，通过改写政策换取资金解冻。本周《洛杉矶时报》披露政府向加州大学洛杉矶分校（UCLA）提出的和解方案，指控加州大学系统未能妥善处理反犹太主义投诉，要求彻底改革校方政策。加州大学校长詹姆斯·米利肯在9月15日致社区信中警告："重大研究及其他联邦资金的损失将重创加州大学系统，对师生、教职员工、患者及全体加州人造成真实且长期的伤害，还将终结惠及全美民众的救命研究。我们所做的工作拯救生命、推动经济增长、为每个社区的家庭创造机会，太多人依赖我们履行使命。"
NIH未来面临不确定性，特朗普提议将下财年预算削减180亿美元，但众议院拨款委员会近期驳回该计划，批准延续2025年的480亿美元拨款。斯科顿敦促国会恢复2026财年NIH全额拨款，"使生物医学事业能兑现改善全体美国人健康的承诺"。与此同时，部分州正自主行动：《纽约时报》9月13日报道，加州民主党人拟创建州级NIH，需立法者和选民批准230亿美元债券用于支持大学、研究者和医疗机构；此前马萨诸塞州州长莫拉·希利已提议提供4亿美元州研究资金。
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