当Daniel Haders博士在风险投资领域工作时，他一直在寻找一家真正值得投资的AI驱动药物研发公司。然而，他找到的却是改变他职业生涯轨迹的东西。
Haders和他的团队毫不费力地发现，许多公司充斥着数据和计算机科学家，他们试图解决化学或生物学问题，却不理解其中的生物机制。其他时候，他们发现化学家和生物学家将AI视为一种商品，而不是需要专业知识的东西。即使他们遇到了战略更广泛的企业，这些团队似乎也从未成功开发出一款药物。
"我们发现不同学科似乎没有很好地融合在一起，因此最终我们意识到需要创建这样一家公司，" Haders在波士顿举行的Fierce Biotech Week活动间隙告诉Fierce。"我们组建了一个团队，来打造我们认为的下一代AI药物研发公司。"
Haders花了过去七年时间做这件事。在2019年创立Model Medicines后，这位CEO亲自挑选了理解数据科学、计算机科学、化学、生物学和药物开发的员工。虽然这种方法看似直接，但Haders知道，要突破AI药物研发的炒作并取得切实成果，他需要另辟蹊径。
"从技术角度看，我们认为当所有人都在'Z'字形前进时，我们应该'之'字形前进，"他说。
除了团队构成外，这家去年被评为"Fierce Medtech 15"的公司还重新思考了如何训练其AI模型。Haders用采访室作为隐喻来解释这一理念。
"如果这个房间中的每个点都代表一种可能性，但你所有的训练数据都来自这里的一小块区域，那么你的模型将只学会化学空间的这一区域，而无法发现实际上在那边角落的药物，"他说。
在风险投资和药物研发领域，突破性疗法和同类首创治疗药物才是王道。因此，Haders建立公司时反其道而行之。他希望组建更小、更紧密的团队，而非庞大的团队。同样，公司使用小而多样化的数据训练集来预测异常化学结构。
AI模型是在更通用的中央处理器(CPU)上训练的，而非通常用于执行机器学习所需并行计算的更快图形处理器(GPU)。
据Haders称，结果是一家已经虚拟筛选3250亿个分子并发现产生有前景数据的药物候选物的公司。"我们创造创意模型，"他说。
Haders以MDL-4102为例说明公司创意AI的能力。这款临床前候选药物靶向雄激素受体和溴结构域4(BRD4)，后者是一种调节基因表达的蛋白质，也是强生去年以30亿美元收购Halda Therapeutics的原因，后者拥有前列腺癌药物。
但多年来，BRD4抑制剂也遇到了几个障碍，原因在于剂量限制性毒性。《英国癌症杂志》的研究人员在2020年写道："毫无疑问，BRD抑制剂作为抗癌药物具有未被开发的潜力。然而，其开发没有明显的'低垂果实'。"
Haders表示，MDL-4102是Model AI如何"爬树摘取顶端果实"的一个例子。他指出该药物有潜力解决肿瘤学、心血管甚至更多退行性疾病。"它的效力、选择性和新颖性组合在文献中超越了所有已知物质。"
作为Model 3250亿分子虚拟筛选的产物，MDL-4102目前正在进行IND(新药临床试验申请)前研究，希望明年申请进入人体研究的许可。
明年也是这家位于加利福尼亚州拉霍亚的公司希望将MDL-001——一种靶向保守病毒聚合酶机制的广谱抗病毒药物——推进到临床的时间。Model去年参加了各种传染病和肝病会议，宣传公司称"在呼吸道和肝病毒以及高风险共感染方面展示出临床前活性"的临床前数据。
临床前结果还包括这样的发现：MDL-001的每日一次剂量可能具有与瑞德西韦(即COVID-19治疗药物Veklury)相当的抗病毒效果，并且在减少肺部病毒积累方面优于Paxlovid的两种活性成分之一nirmatrelvir。
Haders强调了不臃肿的训练模型的重要性，这是他希望AI能够开发出一系列获批药物的关键。
"你要追求的是异常值。如果你的数据过多且过于密集，你只会重新发现已经发现的东西。你可能会发现更浅的黄色或更深的黄色，但不会发现新的颜色，"他告诉Fierce。
"我们需要发现新的颜色，"这位CEO补充道。
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