人类口腔中存在着影响口腔健康以及心脏、肠道和自身免疫状况的微生物群落。如今，研究人员创建了迄今最全面的人类口腔微生物目录，发现了数千种先前未知的物种，并揭示了口腔微生物、牙龈疾病与全身健康之间的联系。
这些发现发表在《细胞宿主与微生物》期刊上，有助于改进微生物识别、突出口腔-肠道微生物联系，并为口腔健康研究提供资源。
现代基于DNA的方法已揭示了许多先前未知的物种，但现有数据库主要涵盖实验室中易于培养的细菌。因此，韩国首尔延世大学（Yonsei University）的车俊亨（Jun Hyung Cha）领导的研究团队着手从数千个口腔DNA样本中组装高质量的微生物基因组。
综合目录
研究人员创建了一个微生物目录，称为HROM（人类口腔参考微生物组），包含来自3,426个物种的72,641个高质量基因组。其中半数以上物种此前未被描述过。作者表示，HROM提供了比现有目录大得多的参考，使科学家能够更准确地在DNA样本中识别口腔细菌。
研究团队还识别出超过1,100个新的Patescibacteria物种，这些细菌基因组较小，在口腔中作为其他细菌的寄生虫生存。尽管体型微小，Patescibacteria似乎发挥着重要作用，包括促进生物膜形成、保护其他细菌免受环境压力、输送营养物质以及防御病毒。
一组先前未知的此类细菌与牙周炎（一种严重的牙龈疾病）相关。研究人员发现，这些细菌与众所周知的病原体***牙龈卟啉单胞菌（Porphyromonas gingivalis）***一起，有助于预测牙周炎。
疾病关联
将HROM与肠道微生物组的综合目录进行比较，研究团队识别出330个同时存在于两种环境中的细菌物种。某些物种同时存在于口腔和肠道中，而其他物种通常在口腔中发现，但偶尔也会出现在肠道中。
作者表示，这些细菌在患有心脏、肠道和肝脏疾病的人群中更为丰富，表明它们可能促进全身性炎症。例如，其中几个物种可以预测结直肠癌。
研究人员补充说，这些发现表明口腔微生物可能影响远超口腔的健康。“HROM为口腔微生物组提供了更广阔的视角，并突显了进一步研究口腔微生物与全身性疾病的联系的临床重要性。”
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