人体微生物组由定植于不同身体部位的病毒、细菌、原生动物、真菌和蠕虫等微生物群落构成。其日益被确认为健康的关键决定因素，可提供关键营养供给、抑制病原体定植以及调节宿主免疫等益处。相反，微生物群落组成的异常变化（菌群失调）与营养不良、炎症性肠病、糖尿病、哮喘、焦虑抑郁等精神疾病及癌症等多种疾病的关联正不断扩展。因此，微生物组已成为新型诊断工具开发的新兴靶点，并可通过调控手段发展治疗性疗法。
将微生物组用于上述目标的主要挑战在于个体及群体间存在的显著差异性，该差异由遗传与环境因素共同驱动。这种差异表现为分类单元（如存在/缺失、相对及绝对丰度）及其编码表达功能（如通过菌株变异）的不同。此类差异预计将催生从普适于群体的诊断与疗法，到需根据个体定制的个性化方案的完整谱系。除直接靶向微生物组的疗法外，近期研究开始揭示个体微生物组构成与其治疗响应能力之间的关联，凸显了建立"治疗友好型微生物组"策略的迫切需求。
本特刊旨在汇集聚焦微生物组在精准医疗中作用的研究文章，将展示微生物组变异规律、对患者治疗响应能力的影响机制及相应作用原理的最新认知。此外，特刊将重点呈现正在开发的创新方法与策略，包括整合其他组学数据集，以基于个体现有微生物组预测个性化生物标志物与治疗方案。
John Parkinson博士是加拿大多伦多病童医院高级科学家，同时担任多伦多大学生物化学与分子遗传学系教授。其研究结合计算与基因组学方法，探究微生物对人类健康的影响。团队重点解析病原体感染致病机制，应用18S rRNA调查和全微生物组RNA测序（宏转录组学）技术，研究肠道中原生动物微生物的贡献，尤其关注炎症性肠病与营养不良背景下的作用。
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