随着研究人员揭示了人体微生物组在诊断和治疗方面的潜力，一份新的路线图强调了标准化、更好的证据和临床医生教育的迫切需求，以改变患者的护理方式。
《细胞》杂志最近发表的一篇观点文章概述了将微生物组科学转化为临床实践所面临的挑战、机遇和必要行动。
测序技术和生物信息学的进步使得对肠道菌群的组成和功能潜力进行全面映射成为可能，并将微生物组紊乱与多种人类疾病联系起来。机制研究揭示了肠道微生物组在人类健康和疾病中的关键作用，引发了对其治疗和诊断潜力的浓厚兴趣。
然而，由于各种因素，包括人类微生物组的异质性和复杂性、缺乏标准化协议、后勤和方法上的挑战以及临床医生对微生物组科学的有限熟悉度，微生物组科学尚未完全应用于临床实践。此外，虽然生物学证据可能支持肠道微生物组在医学中的应用，但直接的临床证据往往不足，且研究结果经常缺乏在大规模、多样化人群中的验证。这种缺乏整合证据和临床医生的有限熟悉度阻碍了其在常规实践中的整合。
将微生物组科学转化为临床实践
人类微生物组在临床医学中具有作为诊断工具的多种应用潜力。最近的研究表明，微生物组具有作为诊断工具的潜力，生物信息学和机器学习使复杂数据能够转化为临床相关指标。然而，临床实施受到未解决的问题的限制，包括标准化、成本效益和在不同人群中的验证。最近的研究提供了间接或直接的证据，支持在临床环境中实施微生物组诊断。
例如，两项对地理上多样化的数据集进行的宏基因组分析发现了与结直肠癌（CRC）一致相关的微生物特征，从而提高了粪便隐血试验的诊断准确性。一项对近1000名接受结肠镜检查的患者的大队列研究表明，两种CRC前体——管状腺瘤和无蒂锯齿状腺瘤具有不同的微生物特征，突显了微生物组作为CRC筛查工具的潜力。
尽管有这些潜力，但仍有一些问题阻碍了肠道微生物组在医学中作为诊断工具的应用。例如，尽管消耗品和设备成本逐步降低，但微生物组分析技术尚未得到广泛应用。除了技术问题外，临床实施还面临一些关键挑战，包括标准化、临床效用和成本效益等问题。
直接面向消费者的（DTC）微生物组检测作为一种个性化健康评估手段越来越受欢迎。然而，这引发了关于质量控制、标准化、临床效用和监管监督的担忧。事实上，这些测试表现出显著的分析和方法上的异质性。此外，DTC服务提供的饮食建议和健康风险评估往往缺乏强有力的科学依据，可能导致误解。专家呼吁采取监管措施，以限制潜在误导或临床无关信息的传播。
加速微生物组在临床实践中整合的行动
肠道微生物组的复杂性使得设计临床试验变得困难，从而阻碍了研究向临床实践的转化。然而，最近的各种倡议试图标准化微生物组研究的多个方面。这些倡议包括人类微生物组行动计划、加强微生物组研究组织和报告（STORMS）清单、微生物组质量控制项目和国际人类微生物组标准项目。最近的努力还包括关于微生物组测试的国际共识声明以及欧盟将微生物组分类为“人类起源物质”的法律分类，旨在协调监管框架。
微生物组研究的前景值得加强和改进微生物组临床试验，以生成可转化的成果。这一过程将涉及一系列行动，其中许多已经在进行中。这些行动包括改进样本量估算、将临床研究统计方法应用于微生物组试验以及使用系统性元分析指南（如PRISMA清单）进行系统性元分析。
此外，微生物组试验通常包括非临床的主要终点。然而，主要临床结果可以更顺利地将结果转化为实践。此外，相关研究人群对于回答临床上重要的需求是必要的。值得注意的是，将结直肠癌（CRC）与微生物组特征联系起来的研究往往集中在晚期患者身上，而筛查具有癌前病变的个体则对公共卫生更具影响力。
微生物组疗法已被研究为传统宿主导向疗法的替代方案；然而，它们与宿主导向疗法的结合仍大部分未被探索，但可能会通过针对宿主和微生物组决定因素提供协同益处。这种策略涉及针对宿主和微生物组特征，增加了成功的机会。然而，如果仅限于学术环境，实施这些行动可能会具有挑战性。也就是说，学术界缺乏工业界在应用研究方面的速度和能力。
学术中心相对于医疗网络而言是少数，后者具有更大的招募潜力。这对于旨在发现微生物生物标志物的大规模关联研究尤为重要。因此，除学术界之外的其他利益相关者，如工业界和非学术医疗提供者，在将微生物组科学转化为临床实践方面至关重要。然而，需要谨慎合作以平衡科学严谨性和商业利益。
结论
总的来说，微生物组研究继续产生高度可靠且引人注目的发现，具有重大意义。微生物组诊断主要用于评估疾病风险、预测治疗反应或优化微生物调节。尽管处于初级阶段，但这些方法正在提供可靠的发现，这些发现在不同的临床环境中可能易于验证和重现。
微生物的治疗操作在过去几年里经历了显著的发展，从方法薄弱且零星的经验发展到可重复且更个性化的疗法，其中一些已经进入医疗市场。
尽管有这些令人鼓舞的见解，微生物组科学仍远未融入临床医学。关键举措——包括研究标准化、改进临床试验设计以及增强临床医生教育和合作——对于将微生物组科学转化为临床实践至关重要。
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