内窥镜医生谢尔盖·拉塔耶夫向伊兹维斯佳报表示，药物对肠道微生物组的影响具有长期性，且不仅限于抗生素。拉塔耶夫医生任职于联邦国家预算科学机构“彼得罗夫斯基院士命名的俄罗斯国家研究中心”第2号临床诊断中心，他于10月13日指出：“在我的日常诊疗中，每天观察数百名患者的肠道黏膜状态，微生物组健康问题并非抽象概念，而是直接关联到我研究中所见的影像数据。这些发现对重新思考药物处方策略至关重要。”
塔尔图大学的研究证实了胃肠病学家长期的疑虑：药物对肠道微生物群的影响可能并非短期事件，而是长期的“重编程”。短期抗生素疗程后，部分细菌可能在数周内恢复，但完全回归原始物种多样性可能需要数月甚至数年。医生指出，某些有益菌种可能永久消失。至于抗抑郁药和β受体阻滞剂等其他药物，证据显示其影响可持续多年，构成新的警示信号。即使停药后，身体仍可能残留“代谢痕迹”，持续影响健康。许多非肠道靶向药物在通过肠道转运或经胆汁排泄时，会直接接触微生物组。
“但机制更为复杂。抗抑郁药、抗焦虑药物和β受体阻滞剂作用于神经系统，而大脑与肠道存在直接关联——即‘脑-肠-微生物组轴’。通过改变神经系统状态，药物会调整肠道蠕动、血液供应和分泌功能，为细菌创造新栖息地，导致某些菌种占优而其他消亡，”拉塔耶夫解释道。
微生物组恢复是复杂且个体化的过程，但可行。目前最激进有效的方法是粪便微生物组移植（FMT），即将经过严格筛查的健康供体的平衡细菌群落移植到患者肠道。该方法目前已用于复发性艰难梭菌感染治疗，未来或可用于纠正药物治疗的后续影响。
特选益生菌和益生元也能提供帮助，但不存在通用药丸：选择必须个体化，且市售益生菌效果常受限。饮食仍是基石：多样化高纤维饮食——包括蔬菜、水果、全谷物以及无糖开菲尔、酸菜或酸奶等发酵食品，能为本土有益菌群创造最佳生长条件。
这位内窥镜医生强调：“本研究是支持个性化医疗的又一有力论据。‘不伤害’原则正进入新阶段。处方任何药物，尤其是长期疗程时，医生应不仅考虑直接适应症和禁忌症，还需评估其对微生物组的潜在影响。这对已有胃肠道问题的患者尤为重要。”他总结指出，未来处方前或应分析患者微生物组初始状态以预测风险和副作用。即便当下，处方抗生素时，患者也应与医生讨论通过饮食及必要时益生菌支持微生物组恢复的策略。
《科学每日》期刊报道称，数年前服用的药物仍可能持续影响肠道微生物组。科学家发现，多数药物会在微生物组中留下印记，该影响在治疗结束后长期存在。
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