摘要
背景
与分子特征相关且与胶质瘤易感性相关的遗传变异可为识别和优先选择药物靶点提供因果证据。
方法
我们对胶质瘤进行了全面的双样本孟德尔随机化(Wald比率和/或IVW)和共定位分析。从15个脑区获得的11,985个基因表达测量值、13,285个剪接异构体和10,198个蛋白质丰度测量值中,识别出可作为工具变量的特征(QTLs P < 5 × 10^-8)。胶质瘤汇总级数据提取自一项包含12,496例病例和18,190例对照的全基因组关联荟萃分析。
结果
我们发现了22种分子特征(涉及18个基因/蛋白质)对胶质瘤风险具有因果效应的证据。其中13种分子特征此前已被证实与胶质瘤风险相关,另有5种为新发现:HBEGF (5q31.3)表达水平与所有胶质瘤[OR 1.36 (95%CI 1.19–1.55);P = 4.41 × 10^-6];CEP192 (18p11.21)剪接异构体与胶质母细胞瘤[OR 4.40 (95%CI 2.28–8.48);P = 9.78 × 10^-4];FAIM (3q22.3)剪接异构体与所有胶质瘤[OR 2.72–3.43;P = 1.03 × 10^-5至1.09 × 10^-5];SLC8A1 (2p22.1)剪接异构体与所有胶质瘤[OR 0.37 (95%CI 0.24–0.56);P = 5.72 × 10^-6];D2HGDH (2q37.3)蛋白与所有胶质瘤[OR 0.86 (95%CI 0.80–0.92);P = 5.94 × 10^-6]。
结论
我们为胶质瘤研究中基因及其蛋白质产物的优先选择提供了强有力的因果证据。研究结果突显了选择性剪接在胶质瘤发生中的机制重要性,以及作为探索药物靶点的潜在途径。
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