哥伦比亚大学研究人员的最新发现表明,即使在原发部位生长时,胰腺癌细胞已经开始表达决定它们将转移至何处的基因。这项发表在《自然·遗传学》(Nature Genetics)上的研究揭示了癌症转移的新特点,并指出了预测和阻断这一致命现象的新策略。
该项目始于十年前,当时赫伯特·欧文综合癌症中心(HICCC)精准肿瘤学和系统生物学研究项目的联合负责人古拉姆·曼吉(Gulam Manji)医学博士/哲学博士被胰腺癌患者预后的显著差异所震撼。仅转移到肺部的肿瘤患者比转移到肝脏的患者预后要好得多。
曼吉表示:"看到仅发生肺部转移的患者预后良好令人欣慰,但同时作为研究人员又感到非常沮丧,因为我们并不真正理解其中的生物学机制。"
克服障碍
哥伦比亚大学拥有大量的肿瘤标本库,但曼吉设想的实验需要对每个样本进行详细的临床注释。他召集合作者、学生和博士后,让团队筛选了几百个病例,最终找到了131名胰腺肿瘤仅向肺或肝脏发生孤立转移的患者。
下一个挑战是分析肿瘤标本,这些标本通常包含癌细胞、免疫系统正常细胞和邻近组织的混合群体。为了研究它们,研究人员开发了单核RNA测序和全基因组测序的新方法,获得了关于单个细胞基因表达模式的详细数据。赫伯特·欧文综合癌症中心肿瘤生物学和微环境研究项目的成员本杰明·伊扎尔(Benjamin Izar)医学博士/哲学博士领导了项目的计算生物学方面,从海量的测序数据中提取并验证了研究结果。
为未来访客准备的"语言课程"
通过应用一系列新技术和分析进步,并整合其他几个数据集,伊扎尔的研究小组偶然发现了一个有趣的观察结果。
伊扎尔表示:"来自患者原发肿瘤的癌细胞,如果最终在早期在肝脏或肺部复发,它们会采用与其最终目标器官相似的细胞状态。换句话说,它们已经'会说正确的语言',以便最终融入它们未来的器官'社区'。"
即使在胰腺中的原发部位,肿瘤细胞已经模仿目标器官的细胞,使它们能够在目标器官中存活。一个关键问题是,DNA中的特定变化是否导致了这一观察结果。研究人员应用了机器学习方法,并研究了额外的大型患者数据库,试图找到答案。
伊扎尔表示:"我们无法确定一个能解释向肝脏或肺部趋向性的单一遗传事件。虽然我们必须保持对替代解释的开放态度,但到目前为止,我们无法为这一引人入胜的结果找到遗传学原因。"
研究人员还观察了其他类型癌症的培养细胞,发现保守的特征表明存在相同类型的转移预判能力。曼吉说:"现在关键的问题是,是什么'开关'让这些细胞进入这些不同的程序?"
曼吉强调,这些结果仍需要其他研究人员和更多样本的验证,但他对这些结果可能对患者护理产生的影响感到兴奋。在不久的将来,他希望医生能够通过预测肿瘤可能转移的位置来改进监测策略。展望未来,基因表达谱可能指向新的药物靶点。
曼吉表示:"在预测性特征中,很可能嵌入了使这些肿瘤成功建立转移微环境的决定因素。干扰这些关键决定因素是下一个挑战,这可能会产生针对肝转移的个性化药物。"
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