催化剂驱动的新型分子骨架获取方法助力药物发现Catalyst-Driven Access to Novel Molecular Scaffolds for Drug Discovery

环球医讯 / 创新药物来源:medvoltai.substack.com美国 - 英语2025-09-08 10:28:55 - 阅读时长3分钟 - 1285字
加州大学圣塔芭芭拉分校与合作伙伴开发出酶催化-可见光自由基协同反应平台,该方法通过生物催化与光化学的融合,实现了六类新型分子骨架的多样性合成,突破了传统反应在选择性与底物适用性间的平衡难题。其水相反应体系符合绿色化学原则,产物具有类药分子特征,结合AI驱动的化学空间分析,为下一代药物发现提供了突破性工具。
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催化剂驱动的新型分子骨架获取方法助力药物发现

药物发现新突破:生物催化与光化学的协同创新

在寻找新型治疗药物的过程中,开发具有独特结构的分子骨架始终是药物化学领域的核心挑战。加州大学圣塔芭芭拉分校(UCSB)联合匹兹堡大学及普罗兹米克斯有限公司(Prozimix Ltd.)近期推出的酶催化-可见光自由基协同反应体系,成功将生物催化可见光驱动自由基化学相结合,为药物化学家开辟了进入新化学空间的创新路径。该技术能高效构建包含立体结构的生物相关骨架,突破了传统药物合成方法的局限。


核心创新:酶-自由基协同催化系统

该方法的核心在于由酶-光催化剂双系统介导的多组分自由基偶联反应,其反应机制包括:

  • 光催化剂在可见光激活后
  • 从N-羟基邻苯二甲酰亚胺酯(氧化还原活性酯)、烯烃和醛类底物中产生自由基
  • 自由基中间体在工程酶活性位点内进行立体选择性成键

这一双重催化体系能在水相环境中构建六种截然不同的分子骨架,包括:

  • β-氨基酸衍生物
  • γ-内酰胺
  • γ-内酯
  • 吡咯烷
  • 四氢呋喃
  • 多手性中心饱和杂环

通过更换醛类或烯烃组件即可定向调控产物类型,而无需改变酶或核心方法论,展现出前所未有的合成灵活性。


突破性机制:自由基控制与生物精度的融合

从反应机理层面看,该技术成功实现了短寿命自由基中间体在酶活性位点内的精准操控。传统自由基反应虽具有高反应性,却难以实现选择性控制,而生物催化剂虽能精确调控立体化学,却通常无法兼容自由基过程。

研究团队通过光激发黄素依赖酶,成功控制了自由基偶联的区域及立体化学结果。特别是通过定向进化优化的烯还原酶(EREDs)变体,实现了高选择性的氢原子转移(HAT)和精确的碳-碳键形成。这种生物催化与光化学的有机融合,突破了传统反应的固有局限。


六类分子骨架的绿色合成路径

该方法在保持产物多样性的同时,完全符合绿色化学原则:

  • 采用水相反应体系
  • 反应在常温常压下进行
  • 使用可见光替代传统有害试剂
  • 反应条件温和且可持续

其产物不仅具有合成价值,更展现出类药分子的关键特征:适中的分子量、丰富的立体化学、低极性及平衡的三维复杂性。这些特性显著提高了靶点结合效率膜渗透性口服生物利用度,直接适用于片段筛选与先导化合物优化。


人工智能赋能的化学空间探索

研究团队创新性地将AI分子表征无监督学习应用于产物分类。通过化学空间映射,证实其产物与ZINC和ChEMBL等现有化合物库存在明显区分。这种机器学习与酶催化的深度整合,标志着数据驱动与实验验证相结合的药物发现新范式。


医疗科技前沿展望

Medvolt公司已启动AI驱动的MedGraph™发现引擎,致力于将该技术拓展至:

  • 自动化骨架设计
  • 产物库虚拟筛选与分子对接
  • AI引导的类似物排序优化

通过整合蛋白质-配体建模反应预测算法AI逆合成分析,该平台还可模拟酶活性位点突变,预测反应能学,并优化生物催化转化,真正实现从计算模拟到实验验证的闭环创新。

这项突破性技术不仅推动了药物合成方法学的进步,更通过生物催化、计算化学与绿色光化学的深度融合,为构建可扩展、可持续、智能化的下一代药物发现流程奠定了基础。

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