过去五年约十二项研究声称几乎所有癌症类型都与微生物组存在关联，但约翰霍普金斯大学最新研究推翻了这一结论。该团队对癌症基因组图谱(TCGA)数据库中的25种癌症5,734个组织样本进行全基因组测序分析，发现微生物DNA序列占比远低于既往研究结果。
研究负责人Steven Salzberg指出，该团队通过比对Telomere-to-Telomere和Genome Reference Consortium两大人类参考基因组，成功过滤99.65%的人类DNA序列。在剩余样本中，经严格去污染处理后，固体肿瘤平均微生物DNA占比0.57%，血液癌症为0.73%。与2020年《自然》研究相比，微生物序列数量仅为后者的1/56，最高差异达9,000倍。
对比2022年《细胞》研究发现，当前研究检测到的真菌DNA含量比前作低数百倍。值得注意的是，研究团队在样本中检出了面包酵母（常见实验室污染物）和植物病毒Rosellinia necatrix partitivirus 8，二者均与人类疾病无已知关联。
该研究确认了HPV（宫颈癌/头颈癌）、幽门螺杆菌（胃癌）及具核梭杆菌（肠道癌）等已知致癌微生物的存在。研究数据已通过《科学转化医学》补充材料和在线数据库开放共享。团队强调，在开发基于微生物组的癌症早筛技术时，必须严格验证微生物与癌症的关联性。
研究团队由约翰霍普金斯大学Jennifer Lu、Daniela Puiu和Mahler Revsine共同参与完成。相关成果已发表在《科学转化医学》(DOI: 10.1126/scitranslmed.ads6335)。
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