肠道微生物组对肺、肾、肝、心和脑等多个器官的正常功能至关重要。然而，任何微生物组稳态的破坏都会导致相关器官功能障碍及多种疾病进展。国际微生物组学会科学委员会近期发表研究报告证实，肠道微生物组与肠道、肺、脑及皮肤等人体器官存在双向互作机制。十余年前已有大量证据表明，肠道菌群改变是多种局部及系统性疾病发病的关键因素，因此临床医生必须深入理解微生物组共生与失调的机制。
来自八个国家、十余家权威机构的二十一位国际微生物组学会高级专家在《转化医学杂志》发表题为"微生物组医学：迈向临床革命"的战略报告。该综述全面阐述了人类微生物组在疾病发病中的作用，以及通过肠道微生物组调控实施疾病预防与治疗的创新策略。报告强调，随着人类进化及宿主胃肠道微环境变化，肠道微生物组极易受内外因素影响，其中人工环境微生物组对人类健康具有重大影响。
现有研究充分证实，肠道微生物组通过多向互作机制维持整体稳态，包括肠-肺轴、肠-脑轴、肠-肤轴等菌群-器官互作网络。任何微生物组失调都会显著增加疾病发病风险，例如特定失调可引发胃肠道炎症、代谢及心肾血管疾病，以及神经退行性疾病。
在治疗领域，靶向特定微生物组分或代谢物为多种疾病治疗提供了新工具。除传统益生菌/益生元疗法外，粪便微生物移植（FMT）、代谢物调控、噬菌体及微小RNA等创新策略正进入临床研究阶段。国际微生物组学会创始人、科什研究所暨法国国家健康与医学研究院巴黎大学的马文·埃迪亚斯（Marvin Edeas）教授指出："本报告再次证实医学未来与微生物组质量密切相关。靶向干预微生物组失调是重大挑战，当前另一任务是协同调控线粒体与微生物组。人工智能技术将推动微生物组医学达到新高度——我们可快速诊断微生物组失调、精准调节微生物组，并治疗数百种疾病。"
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