Q: 如何向非专业读者总结您的研究？
我们的研究探讨了细胞外囊泡(EV)中的RNA如何提供与肥胖相关的代谢表型信息。通过使用功能基因组学方法，我们发现这些EV中携带的RNA高度代表了之前与肥胖和2型糖尿病相关的基因和调控元件。值得注意的是，这些EV转录本代表脂肪组织中的调控元件和转录活跃基因，并与包括体重指数和2型糖尿病在内的代谢表型相关。
我们提供了一个路线图，将EV转录分析与遗传学方法相结合，这最终可能指导新型诊断和治疗策略的发展，提高我们预测、预防和治疗肥胖相关疾病的能力。
Q: 您研究的问题是什么？
我们的目标是了解循环EV的情况以及其在肥胖个体和瘦个体之间的差异。我们的重点是EV RNA货物在肥胖和瘦个体之间如何变化，以及将其与大规模人口遗传和转录组数据库整合可以如何提供对肥胖生物学的见解。
Q: 您使用了什么方法或途径？
我们优化了从减肥手术中获取的脂肪组织外植体培养方法以收获EV，并分离循环EV和生成转录组数据。与范德比尔特大学医学中心的Ravi Shah博士和Eric Gamazon博士合作，在计算方面进行了创新，将EV转录组学与群体'omics'数据（如全基因组关联研究(GWAS)、转录组范围关联研究(TWAS)和表型组范围关联研究(PheWAS)）整合在一起。
Q: 您发现了什么？
我们的研究结果表明，肥胖个体中EV-RNA的差异主要由脂肪组织释放的EV驱动，而这些EV中的RNA来自脂肪组织内的不同细胞类型。通过使用功能基因组学方法，我们在瘦和肥胖个体的循环EV中鉴定出282个差异表达的转录本（对应277个独特的基因符号）。
Q: 研究的意义是什么？
我们的研究概述了一种将EV转录组学与大规模遗传研究整合的方法。它还表明，在肥胖中差异表达的EV-RNAs与代谢表型（如肥胖和2型糖尿病）相关的基因有关。这些EV-RNAs代表脂肪组织中的调控元件和转录活跃基因，并与代谢表型相关。
Q: 下一步是什么？
我们目前正在研究这些EV转录本在体重减轻时（无论是通过手术还是药物诱导，如GLP-1激动剂）如何变化。我们还在研究脂肪EV如何向其他细胞（如心脏细胞、肝细胞和脑细胞）发出信号，以介导肥胖相关的合并症。我们的功能基因组学研究已经找到了一些可能用于治疗这些疾病的靶点。
作者名单：除了Chatterjee和Das之外，马萨诸塞州总医院布里格姆分院的作者还包括Guoping Li、Marta Garcia-Contreras、Priyanka Gokulnath、Worawan B. Limpitikul、Olivia Rosina Whittaker、Kathy Luong、Christopher Azzam、Denise Gee、Matthew Hutter、Karen Flanders和Parul Sahu。
论文引用：Chatterjee, E., et al. "The extracellular vesicle transcriptome provides tissue-specific functional genomic annotation relevant to disease susceptibility in obesity," Cell Genomics. DOI: 10.1016/j.xgen.2025.100925
资助：这项工作得到了美国心脏协会战略聚焦研究网络(SFRN16SFRN31280008)、国家心肺血液研究所(1R35HL150807-01)、国家转化科学促进中心(UH3 TR002878)、美国国立卫生研究院、美国心脏协会(23CDA1045944)、国家人类基因组研究所(R35HG010718和R01HG010738)、国家普通医学科学研究所(R01GM140287)和国家糖尿病消化和肾脏疾病研究所(U01DK140952, RC2 DK116691)的资助。
披露：Ravi Shah得到了美国国立卫生研究院的资助。Shaw拥有Thryv Therapeutics的股权并担任其顾问。Shaw是有关心血管代谢诊断和RNA生物标志物的待批专利或披露的共同发明人。Gamazon是Thryv的顾问。他是有关心血管代谢健康和代谢组学方法的披露或专利的共同发明人。Das是Thryv Therapeutics和Switch Therapeutics的联合创始人和顾问，并持有这两家公司的股权，但这些公司没有参与本研究。
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