微生物组核心设施
微生物组核心设施提供细菌和真菌的微生物群落分析以及全基因组测序服务。文库构建可对多种来源的样本进行,包括拭子、组织、土壤、微生物培养物和粪便样本。高通量样本集的处理通过epMotion液体处理系统实现自动化。文库在Illumina MiSeq i100平台上进行测序。
我们如何满足您的研究需求
微生物群落分析
我们提供对多种微生物群落组成的分析服务。
微生物基因组测序
我们提供在Illumina MiSeq平台上对细菌基因组进行测序的两项服务。
微生物DNA提取
我们的DNA提取服务已通过Eppendorf EpMotion液体处理系统和KingFisher自动化纯化系统实现高通量自动化。
MALDI - 微生物分离株鉴定
MALDI生物分型仪用于研究、工业或临床应用中,有效识别纯化微生物分离株的属、种或菌株水平。
菌株收集数据库
StrainDB是密歇根大学可搜索的微生物菌株数据库。
附加服务
探索为您的研究提供的额外服务。
研究支持与核心设施政策
认可我们
我们正致力于提高微生物组核心设施在更广泛研究社区和资助机构中的知名度。我们要求客户在出版物中通过以下句子来认可我们的服务,以支持我们的团队:
"DNA提取、文库制备和下一代测序由密歇根大学微生物组核心设施(RRID SCR_02680)完成。"
我们感谢您对此项工作的帮助。
支持信请求
微生物组核心设施很乐意为资助申请提供支持信。请发送电子邮件申请信件。请包含您的姓名和所属机构、您提交的申请类型、提案标题、您将使用的核心设施服务以及项目简要描述。
核心设施通用政策
- 用户同意在由此工作产生的任何出版物中包含/认可微生物组核心设施的使用。请参阅"认可我们"部分。
- DNA样本将在测序后保存90天(约3个月),然后核心设施工作人员将处理这些样本。如需,核心设施将按运输成本(适用情况下)返还任何纯化的DNA样本。
- 用户负责下载核心设施提供的所有数据文件。序列数据将在Dropbox上保存6个月,之后将归档。检索和发送归档数据的费用为75美元。
- 用户需遵守所有涉及人类或动物样本研究的机构、州和联邦规则。
- 在提交时未指定的样本处理请求可能需要额外的处理时间和超出初始估计的费用。
我们的团队
Thomas Schmidt博士
内科学教授
微生物学和免疫学教授
医学院
生态学和进化生物学教授
文理学院
Karrie K Black,工商管理硕士,临床研究助理
财务管理员
Christina Cartaciano,理学硕士
微生物组核心实验室专家
Kyle Stamper
微生物组核心实验室专家
科学顾问委员会成员
Robert Pickett Dickson医学博士
Galen B Toews医学博士肺部和重症医学传承教授
内科学教授
微生物学和免疫学教授
肺部和重症医学研究员副主任
医学院
Eric C Martens博士
微生物学和免疫学教授
医学院
联系我们
如需讨论项目,欢迎随时联系我们。
微生物组核心设施位于医学科学研究大楼I(MSRB-I,1504室)。
电子邮箱:microbiomecore@umich.edu
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