Illumina与Nvidia将在药物发现和人类健康领域应用基因组技术和人工智能(AI)技术。这项合作是在第43届年度J.P.摩根医疗保健会议上宣布的,涉及两家技术领导者的协作。
Illumina将提供其DRAGEN分析软件,用于Nvidia的加速计算平台,并使Nvidia的BioNeMo工具可以在Illumina的Illumina Connected Analytics(ICA)平台上使用。通过整合这些技术,双方希望在全球范围内扩展DRAGEN和Illumina多组学分析的应用范围,使任何可以访问Nvidia计算平台的用户受益。
Illumina全球软件和信息学负责人Rami Mehio表示:“Nvidia在构建GPU作为加速平台方面取得了巨大成功,他们拥有广泛的GPU分布。我们将共同努力,确保DRAGEN能够在GPU上运行。” 这项工作已经进行了近一年,但仍需一些时间才能完成。“我们的代码量很大,将其高效移植到GPU上需要时间。两个团队一直在为此努力,我们已经有了原型,但尚未达到生产质量。我们仍在添加功能和修复错误。”
Mehio补充说:“预计在今年年底前我们将有可用的产品。”
Nvidia医疗和生命科学副总裁Kimberly Powell指出:“各国希望保护其人口数据,同时创造条件以建立世界级的医疗系统。因此,通过将DRAGEN引入Illumina平台并在我们的GPU上运行,我们有一个独特的机会,能够将强大的基因组学能力带入这些国家的主权AI项目中。”
Nvidia和Illumina还同意在使用Illumina Connected Analytics推进多组学数据分析方面进行合作,开发新的生物学基础模型,并计划将Nvidia的图像处理和单细胞三级分析工具集成到Illumina Connected Software中。双方的研究人员还将致力于通过Illumina Connected Analytics集成一系列Nvidia技术,包括Nvidia RAPIDS加速数据科学软件、Nvidia BioNeMo生成式AI平台以及Nvidia MONAI框架等。
Illumina首席执行官Jacob Thaysen博士在由Nvidia首席执行官Jensen Huang主持的一次非正式“炉边谈话”中提到:“结合其他信息和其他组学,将为我们提供更深入的生物学见解。虽然单独解析DNA已经非常困难,但当我们将所有组学结合起来时,挑战呈指数级增加。这变得如此复杂,以至于我们需要巨大的计算能力和AI来真正理解和处理这些数据。”
Nvidia与Illumina的合作旨在进一步扩大全球基因组市场——根据Precedence Research去年12月31日发布的一份报告,该市场去年估值为379.4亿美元——并帮助实现突破,如识别目标、开发临床阶段药物和发现生物标志物。
Powell在第43届年度J.P.摩根医疗保健会议上详细介绍了此次合作及其潜在客户。“我们将共同开发新的应用程序,将基因组基础模型和实时单细胞应用引入Illumina Connected Analytics,并将基因组的可访问性和实用性扩展到新市场,如药物发现。”
Illumina首席技术官Steven Barnard博士表示,与Nvidia的合作契合了Illumina的三大技术战略支柱:继续提供市场领先的仪器和测序服务;扩展多组学内容;成为生物数据解读和分析的引擎。
此外,Nvidia当天还宣布了与其他三个合作伙伴的合作关系,分别是IQVIA、梅奥诊所和Arc研究所。这些合作旨在利用AI加速病理学基础模型的开发、个性化诊断和治疗,以及生物医学发现。
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