尽管基因疗法作为一种有希望的替代疗法正在出现，但造血干细胞移植（HSCT）仍然是这种遗传性血液病的唯一广泛可及的治愈选择。
“理想的移植候选人最好是8岁以下的儿童，但实际上直到15岁他们的效果都很好，”意大利佛罗伦萨Cure2Children基金会的儿科血液病-肿瘤学和干细胞移植专家Lawrence Faulkner博士指出。他补充说，如果在移植前接受了最佳输血和定期铁螯合治疗，儿童尤其适合进行移植。
2016年的一项研究显示，18岁以下患者接受HSCT后的2年总生存率（OS）和无事件生存率（EFS）分别为88%和81%。来自人类白细胞抗原（HLA）匹配兄弟姐妹的移植提供了最佳结果，OS和EFS率分别为91%和83%。此外，该研究表明，最佳移植效果的年龄阈值约为14岁，在此之前进行移植的OS率范围为90%至96%，EFS率为83%至93%。
历史上，从匹配兄弟姐妹供者处接受移植的患者成功率最高，但随着预处理方案和T细胞耗竭策略的进步，其他情况下的OS和EFS率也有所提高，例如来自匹配无关或单倍体相合供者的移植。
“过去确实如此，你需要一个完美的匹配兄弟或姐妹，或可能是无关供者，但这个领域已经发生了变化，”约翰霍普金斯医学院的Robert Brodsky博士表示。
Brodsky告诉《MedPage Today》，这种情况发生的原因有很多，其中一个重要原因是HLA分型更好。然而，“一个巨大的飞跃”是植入成功率显著提高和移植物抗宿主病（GVHD）减少，这主要是由于使用了移植后环磷酰胺。
2020年的一项研究中，研究人员采用了一种程序，包括药理学移植前免疫抑制阶段和两次地塞米松和氟达拉滨疗程，然后进行移植前氟达拉滨加白消安预处理，以及移植后GVHD预防用环磷酰胺、他克莫司和霉酚酸酯治疗，用于从单倍体相合供者处接受移植的严重地中海贫血患者（中位年龄12岁）。3年预期OS和EFS率均为96%，7%的患者发生了严重GVHD。
研究作者写道：“这表明单倍体相合同种异体干细胞移植在严重地中海贫血患者中的结果是可以接受的，现在非常接近于使用匹配供者的同种异体HSCT预期的结果。”
在中国的一项针对依赖输血的地中海贫血患者的研究中，今年在美国血液学会年度会议上展示的结果显示，整个队列的2年OS和EFS率均为95%。对于接受匹配兄弟姐妹供者移植的患者，这些比率分别为97%，而匹配无关供者为93%，单倍体相合供者为95%。
移植相关死亡率总体为4.4%，在匹配兄弟姐妹组中较低（2.5%），而匹配无关组为6.5%，单倍体相合组为4.6%。匹配兄弟姐妹组的GVHD发病率显著低于其他组。
研究人员建议，环孢素A、甲氨蝶呤、霉酚酸酯和抗胸腺细胞球蛋白的GVHD预防方案“有效防止了匹配兄弟姐妹供者患者的GVHD”，而使用替代供者进行移植的患者“将受益于改进的GVHD预防策略”。
对于Faulkner向《MedPage Today》指出的，理想情况下，β地中海贫血患者应在16岁或更年轻时接受移植。
主要原因是他解释说，慢性输血导致的血色病会降低患者成功移植的机会，因为它可能导致不可逆的器官损伤。“地中海贫血通常在生命的头两年内被诊断出来，如果患者定期输血，铁会在体内积累，可能需要7到8年才会对内分泌系统、心脏或肝脏造成不可逆的器官损伤。因此，我们希望在任何不可逆的器官损伤发生之前进行移植，以便患者能更好地耐受移植。”
此外，他补充说，“众所周知，出于尚未完全明确的生物学原因，儿童通常在移植方面表现更好，GVHD的发生率也更低。”
然而，有迹象表明，治疗的改进可能会使成人移植更具可行性。去年，英国国家医疗服务体系（NHS）首次为依赖输血的地中海贫血成人提供干细胞移植。
NHS的证据审查表明，每10个接受HSCT的依赖输血的地中海贫血成人中，有六到七个人可以在长达23年内不患地中海贫血。
审查作者表示，这些发现对接受标准输血和螯合治疗的依赖输血的地中海贫血成人非常重要，因为同种异体HSCT治疗了TDT的根本原因，并具有潜在的治愈性（假设没有移植物排斥或失败等并发症），而标准治疗只是控制疾病。
他们补充说，“如果没有HSCT，患有TDT的人需要终身输血和铁螯合治疗，并定期监测治疗效果和筛查并发症。”
两种基因疗法——betibeglogene autotemcel (Zynteglo)和exagamglogene autotemcel (Casgevy)已被批准用于治疗β地中海贫血。
虽然这“令人兴奋”，但Brodsky指出，基因疗法仍需要有毒性的骨髓消融预处理方案，而且“成本过高”（bluebird bio为betibeglogene autotemcel定价为280万美元）。
Brodsky说，“基因疗法需要继续发展。它真的还处于起步阶段。如果25年前你问我关于骨髓移植的问题，我会告诉你有20%到30%的死亡率，30%到40%的人会患上移植物抗宿主病，其中一些是慢性的，还有各种晚期感染。”
与此同时，Brodsky建议，基因疗法确实为一种复杂的疾病提供了另一种选择，有些β地中海贫血患者的选择有限，因为他们没有合适的供者或有抗HLA抗体。
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