大规模测序研究显示癌症与微生物组关联极少In extensive sequencing study, scientists find few links between cancer and microbiome - Johns Hopkins Biomedical Engineering

环球医讯 / 硒与微生态来源:www.bme.jhu.edu美国 - 英语2025-09-09 01:30:11 - 阅读时长2分钟 - 761字
约翰斯·霍普金斯医学研究团队通过分析5734个癌症组织样本发现,固体肿瘤中微生物DNA占比仅0.57%,血液癌症中为0.73%,表明此前多数癌症与微生物组的关联研究可能受污染影响而存在误判。该研究通过严格排除污染物验证了微生物组与特定癌症(如宫颈癌、胃癌)的已知关联,但未发现新关联。
癌症微生物组全基因组测序致癌微生物实验污染癌症早期诊断健康研究
大规模测序研究显示癌症与微生物组关联极少

近日,约翰斯·霍普金斯大学的研究人员在《科学转化医学》发表一项突破性研究,揭示了癌症与微生物组(人体内/表存在的细菌、病毒和真菌群落)关联性极低的结论。该研究分析了癌症基因组图谱(TCGA)数据库中5,734个组织样本(涵盖25种癌症类型),通过全基因组测序技术发现,样本中微生物DNA序列比例显著低于此前同类研究结果。

研究团队负责人、生物医学工程教授史蒂文·萨尔茨伯格(Steven Salzberg)指出,科学验证需通过重复实验逐步完善认知。此项研究采用更严格的污染物筛选方法,剔除了测序过程中混入的环境DNA或设备残留DNA。通过对50,651个微生物基因组的比对分析,最终确认固体肿瘤样本平均仅含0.57%的微生物DNA读段,血液癌症样本为0.73%。

研究特别验证了已知致癌微生物的关联性,如与宫颈癌相关的HPV病毒、胃癌相关的幽门螺杆菌,以及与胃肠癌相关的具核梭杆菌和脆弱拟杆菌。但研究同时发现,此前《自然》和《细胞》期刊发表的某些研究因未充分排除污染物,导致微生物DNA读段数量被高估56倍至9,000倍不等。例如面包酵母菌(酿酒酵母)这类实验室常见污染物在早期研究中被错误关联多种癌症。

研究团队通过双人类参考基因组(端粒到端粒计划T2T和基因组参考联盟)筛选,从原始测序数据中剔除986百万条污染读段。剩余数据中,固体肿瘤样本平均仅含2.4百万条非人类DNA读段,占原始数据的0.35%。该成果已被公开上传至《科学转化医学》补充材料,为癌症早期诊断中微生物组的应用提供了更严谨的研究基础。

该研究由美国国立卫生研究院(NIH)资助,研究数据已向全球科研机构开放共享。约翰斯·霍普金斯大学研究团队强调,随着癌症早筛技术依赖微生物组数据的探索日益增多,准确区分真实生物信号与实验污染至关重要。

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