迄今为止最大的RNA语言模型提供预测行为新方法,助力药物发现Largest RNA language model to date offers new way to predict behavior and boost drug discovery

环球医讯 / AI与医疗健康来源:phys.org新加坡 - 英语2025-11-14 08:13:02 - 阅读时长3分钟 - 1404字
新加坡科技研究局基因组研究所和生物信息学研究所的研究人员与萨格勒布大学合作,成功开发出RiNALMo——迄今为止规模最大的RNA语言模型,该模型通过学习3600万条RNA序列的"语法",能够精准预测RNA的折叠方式、相互作用及功能表现,从而显著加速药物研发进程,减少对冗长实验室实验的依赖,并优化疫苗与RNA疗法设计,使分子更加精确稳定,同时通过揭示疾病状态下RNA的变化支持诊断创新,这一突破有望推动新一代RNA基础药物的开发,为患者提供更精准有效的治疗方案,标志着在RNA科学和人工智能交叉领域取得的重大进展。
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迄今为止最大的RNA语言模型提供预测行为新方法,助力药物发现

RNA在基因表达和疾病发展过程中起着至关重要的作用。然而,由于RNA分子不断改变形状,理解其工作原理长期以来一直是一个重大的科学挑战。

在生物医学科学领域取得的一项飞跃性进展中,新加坡科技研究局(ASTAR)基因组研究所(ASTAR GIS)和新加坡科技研究局生物信息学研究所(A*STAR BII)的研究人员与萨格勒布大学合作,开发了RiNALMo,这是一种能够像解读语言一样"阅读"和解释RNA序列的人工智能(AI)模型。这一突破帮助科学家预测RNA在体内的行为,有可能加速RNA靶向和RNA基础治疗方法的开发。

该研究发表在《自然通讯》杂志上。

RiNALMo的重要性

RNA位于许多现代医学创新的核心,从mRNA疫苗到基因治疗。然而,设计RNA药物或预测其行为长期以来一直缓慢而复杂。RiNALMo通过提供一种强大的新方法来理解和设计用于治疗的RNA,解决了这一挑战。

通过从超过3600万条序列中学习RNA的"语法",RiNALMo可以预测RNA如何折叠、相互作用和发挥作用。这些能力可以通过减少对冗长实验室实验的需求来加速药物发现,同时改进疫苗和RNA治疗设计,实现更精确和稳定的分子。此外,它通过揭示疾病条件下RNA的变化来支持诊断创新。

这些进展可能加速新一代基于RNA的药物的开发,更快地为患者提供更精确和有效的治疗。

RiNALMo的工作原理

RiNALMo是世界上最大的RNA语言模型。它在3600万条RNA序列上进行了训练,使其接触到大量多样化的生物数据,并由6.5亿个参数提供动力,使其能够检测到较小模型会错过的细微模式。这种规模使RiNALMo能够对RNA结构和行为做出更准确的预测,帮助科学家获得以前需要多年实验室工作才能获得的见解。

在测试中,RiNALMo在多个基准任务中表现出最先进的性能,在预测RNA结构和功能方面超过了现有的AI模型。

"将RiNALMo想象成通过无数句子教授模型阅读一种外语,然后要求它用该语言写诗、检测语法和讲述故事。RiNALMo对RNA所做的就是如此,"新加坡科技研究局基因组研究所AI与计算助理主任、萨格勒布大学电气工程与计算学院教授Mile Sikic说。

"在新加坡科技研究局基因组研究所,我们专注于推动基因组学和AI的前沿,以开发新一代RNA靶向或RNA基础药物,"新加坡科技研究局基因组研究所执行主任、RiNALMo项目共同研究员Wan Yue博士说。

"RiNALMo已经证明,不仅有可能学习RNA的语言,还可以以强大的新方式利用这种理解,从预测功能到设计具有治疗潜力的RNA分子。这为下一代基于RNA的药物开发开辟了令人兴奋的机会。"

"自从AI系统AlphaFold展示了AI如何推进3D蛋白质结构预测以来,人们一直在竞相开发更新更好的模型,以探索生物医学研究中未知的领域。通过将RNA结构建模的领域专业知识融入新的AI架构设计中,该团队能够在使RNA可药物化和改进RNA药物方面取得重大飞跃,"新加坡科技研究局生物信息学研究所执行主任Sebastian Maurer-Stroh说。

这项由新加坡主导的研究展示了本地创新如何引领生物学中改进的AI模型,推动RNA科学及其实际应用可能性的边界。

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