被忽视的热带疾病(NTDs)仍然是一个重大的全球健康挑战，对低收入和中等收入地区的脆弱人群影响尤为严重。尽管这些疾病影响巨大，但许多NTDs仍然获得有限的研究资金和药物开发关注。传统的药物发现流程通常漫长且资源密集，促使人们越来越关注成本效益高的策略，如药物再利用和计算药物设计。结构生物学、化学信息学、计算化学和人工智能的进展现在使得通过分子对接、分子动力学模拟、QSAR建模和自由能计算等方法对药物-靶点相互作用进行合理探索成为可能。然而，许多NTDs在分子水平上仍然研究不足，关键病原蛋白的结构数据有限，并且需要标准化、透明和可重复的计算工作流程，以加强计算机预测与实验验证之间的联系。
本研究专题旨在汇集多学科贡献，利用计算策略来识别、再利用和优化针对被忽视热带疾病的治疗药物。目的是增进我们对综合计算方法（包括基于结构的设计、基于配体的建模、人工智能辅助发现和分子模拟）如何弥合虚拟筛选与实验验证的治疗候选物之间差距的理解。它旨在鼓励将预测建模与机制洞察相结合的稳健和可重复的工作流程，最终缩短从虚拟命中识别到可行治疗开发的路径。
为了进一步了解NTDs药物发现和优化的计算方法，我们欢迎涉及但不限于以下主题的文章：
• 被忽视热带疾病的药物再利用策略
• 病原体靶点的基于结构的药物设计和虚拟筛选
• 分子对接和分子动力学在机制阐明中的应用
• 使用自由能计算理解结合亲和力和选择性
• 定量构效关系(QSAR)建模和数据整合
• 用于靶点识别和化合物优化的人工智能和机器学习方法
• 标准化和可重复计算工作流程的开发
• 将计算设计与实验验证联系起来的案例研究
本研究专题欢迎多种类型的文章，包括原创研究文章、综述、小型综述、观点、方法文章和数据报告，特别是那些呈现可重复工作流程、基准研究或对药物化学和转化药理学有直接影响的案例应用。
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