过去十年间，人们越来越认识到肠道微生物组（及其他黏膜表面微生物组）在健康和疾病中的作用。我特别关注两个相关方面：
- 运用一系列系统生物学（‘组学’）技术，更好地理解肠道微生物组组成紊乱如何导致多种人类疾病；这些技术包括微生物组测序、代谢组学等。虽然我的主要兴趣集中在肠道和肝脏疾病，但研究范围远不止于此，包括血液疾病、感染性疾病、风湿病问题，以及肠道微生物组对某些疗法（如免疫疗法）疗效或副作用的影响。
- 研究调控肠道微生物组的不同方法，将其作为治疗多种疾病的新型手段。其中部分方法采用较传统的模式（包括饮食和益生菌），而我的主要专长是使用肠道（粪便）微生物群移植（IMT/FMT）作为‘全生态系统’方法来改变肠道微生物组。
为什么重要
尽管大量证据已表明多种医学疾病中存在肠道微生物组紊乱，但其具体机制仍相对缺乏解释，限制了这一知识迄今为止的临床开发潜力。同样，虽然IMT/FMT对特定肠道细菌感染——艰难梭菌感染（CDI）的复发型患者是一种高效的治疗方法，但我们尚不清楚通过这种方式恢复肠道微生物组是否有助于更广泛的患有其他微生物组相关疾病的患者。此外，IMT/FMT并非没有缺点，进一步了解其疗效机制可能转化为新型、靶向的‘微生物组疗法’，为众多患者提供一种新的治疗范式。
如何惠及患者
如前所述，IMT/FMT对复发性CDI患者是一种总体安全且高效的治疗方法，并已被NICE和国家机构指南推荐（我本人是这些指南的贡献者）。我开展IMT/FMT（以及其他以微生物组为重点的疗法）的试验，评估其对不同疾病的效果，并分析这些试验中的样本，以探索如何从IMT/FMT转向更有效、更具靶向性的治疗选择。
当前研究
- 通过整合分析微生物组、代谢组及其他组学数据集，表征健康与疾病状态下宿主-表型组-免疫的相互作用。
- 探索IMT在多种临床场景中的潜在作用和疗效机制，包括：
- 感染性疾病：艰难梭菌感染、耐药菌肠道定植、尿路感染。
- 代谢和肝脏疾病：包括肥胖、代谢相关脂肪性肝病（MASLD）、原发性硬化性胆管炎（PSC）、酒精性肝炎和肝硬化。
- 血液系统疾病：包括接受干细胞移植的血癌患者。
- 风湿病：包括银屑病关节炎。
- 理解肠道微生物群如何影响药物反应。其中一方面涉及多种肿瘤学场景，以及如何利用这些知识治疗药物诱发的副作用，例如免疫检查点抑制剂相关性结肠炎；另一方面是肠道微生物群如何影响多种疫苗的免疫应答。此外，一个重点领域是肠道微生物群如何影响用于治疗炎症性肠病的生物制剂的疗效。
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