数十年来，妇科检查一直依赖于对阴道微生物组的简化观点，将细菌归类为"好"或"坏"。马里兰大学医学院科学家的新研究挑战了这一假设，揭示出同一物种的细菌可能以根本不同的方式表现，这对女性健康具有重要意义。
目前，妇科检查主要集中在检测阴道微生物组中的两组细菌：通常与健康相关的乳酸杆菌（Lactobacillus），以及与细菌性阴道病（BV）、性传播疾病风险增加和其他不良结果相关的加德纳菌（Gardnerella）。
新研究确定了25种不同的阴道微生物组类型，包括多种主要由加德纳菌占主导的类型，这些类型彼此之间有显著差异。
研究人员开发了两种开源工具——VIRGO2和VISTA，使分析同一物种内不同菌株如何执行不同的生物功能成为可能。
这项研究为女性提供精准妇科护理奠定了基础。
今天发表在《mBio》杂志上的一项新研究中，马里兰大学医学院(UMSOM)的研究人员报告称，长期以来将阴道微生物组基于少数细菌物种分为"最佳"或"非最佳"的观点过于简单化。通过以前所未有的分辨率分析阴道微生物组数据，研究团队确定了25种不同的阴道微生物组类型，并证明同一物种的细菌在其功能潜力上可能存在显著差异，从而影响这些微生物与身体的相互作用。
历史上，阴道健康通常被描述为乳酸杆菌物种与加德纳菌的主导地位对比，后者通常与细菌性阴道病和其他不良生殖及泌尿生殖结果相关。新发现表明，这种分类并不能完全捕捉阴道微生物群落的生物多样性。
马里兰大学医学院基因组科学研究所(IGS)高级微生物组研究与创新中心(CAMRI)的博士后研究员、该研究的主要作者阿曼达·威廉姆斯(Amanda Williams)博士表示："我们的结果表明，仅仅询问存在哪些细菌物种是不够的，我们需要了解它们能够做什么以及正在做什么。我们发现，多种阴道微生物组类型可能由加德纳菌主导，但在其功能特征以及与炎症和不良结果风险的关联上存在差异。"
在确定的25种微生物组类型中，有六种由加德纳菌主导。其中一种在功能和炎症特征上更接近由乳酸杆菌主导的微生物组，这突显了通常被视为单一类别的微生物组内部的生物异质性。
为了实现这种级别的分析，CAMRI团队开发并应用了两种开源计算工具。VIRGO2是一个扩展的基因目录，包含约170万个来自阴道微生物组中细菌、真菌和病毒的基因，使用从五大洲女性收集的样本构建。IGS和CAMRI的研究助理迈克尔·弗朗斯(Michael France)博士领导的一篇最近发表在《自然通讯》上的论文更详细地解释了VIRGO2。VISTA（阴道亚种干扰和分型算法）通过定义宏基因组群落状态类型(mgCST)，使研究人员能够在菌株-群落级别而不是仅依赖物种识别来检查阴道微生物组。
IGS和CAMRI的科学家、马里兰大学医学院微生物学和免疫学助理教授、该研究的资深作者约翰娜·霍尔姆(Johanna Holm)博士表示："这些工具使我们能够研究阴道微生物组在其功能潜力上的差异，以及这些差异如何可能与宿主生物学相关。虽然这项工作不会立即改变临床实践，但它为未来旨在改善风险分层、诊断和治疗策略的妇女健康研究提供了框架。"
研究人员强调，需要进一步研究来确定这些微生物组类型如何与临床结果相关，以及这些信息最终如何可能为诊断和治疗提供更量身定制的方法。
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