摘要
衰老和认知障碍会增加患阿尔茨海默病（AD）的风险，越来越多的证据表明基因组中的转座元件（TEs）在衰老和AD中发挥作用。在这种情况下，TEs失调的机制尚不清楚，但一种可能是表观遗传变化（包括DNA低甲基化和/或染色质结构减少）是年龄和AD相关的TE活性的基础。因此，本研究的目的是生成一个研究衰老和AD中TE表观遗传学的资源，并利用该资源确定表观遗传失调的TEs是否与年龄/AD相关的临床结果相关。
我们对45名健康老年人、轻度认知障碍（MCI）患者和AD痴呆患者的外周血样本进行了RNA测序，观察到MCI和AD中TE转录表达的波动模式，与之前报道一致。随后，我们使用全基因组亚硫酸氢盐测序（WGBS）和转座酶可及染色质测序（ATAC-seq）在相同受试者中表征全基因组DNA甲基化和染色质可及性。我们发现，大多数在RNA测序数据中随着MCI和AD富集/失调的TEs可以在基因组的低甲基化和染色质开放区域中找到。这些TEs包括几个已直接与人类炎症和疾病相关联的元件，并且它们与受试者的认知/功能诊断、年龄以及炎症和神经退行性变的生物标志物相关。总体而言，这些发现与表观遗传改变可能通过调控TE转录在衰老、认知衰退和AD中起重要作用的观点一致。
关键词： 阿尔茨海默病；轻度认知障碍；转座元件。
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