这项有趣的研究提供了关于人类巨细胞病毒(HCMV)感染如何破坏TEAD1转录因子活性,从而导致广泛染色质变化的宝贵信息。然而,这种破坏的确切机制以及这些染色质变化对HCMV复制的影响程度仍不清楚。该研究得到了坚实的证据支持,但通过包括功能分析可以进一步加强这些证据。这项工作将引起病毒学、染色体生物学和转录共调节领域的兴趣。
研究的重要性在于其发现具有理论或实践意义,对相关领域有重要影响。证据的强度在于方法、数据和分析普遍支持这些结论,尽管存在一些次要的弱点。
人类巨细胞病毒(HCMV)感染全球多达80%的人口。在这里,我们显示HCMV感染导致人类染色质可及性和染色质环化的广泛变化,感染48小时后有数十万个基因组区域受到影响。整合分析揭示了HCMV诱导的Hippo信号通路的扰动,通过大幅减少TEAD1转录因子的活性。我们确认感染后TEAD1结合位点、活跃的H3K27ac组蛋白标记和染色质环化相互作用的广泛一致丧失。我们的数据显示TEAD1位于涉及多个改变的重要发育途径的层次结构顶部。HCMV感染通过四种不同的机制减少TEAD1活性:TEAD1结合的染色质关闭、YAP1和磷酸化YAP1水平的降低、TEAD1转录本和蛋白质水平的降低,以及TEAD1第6外显子的使用改变。与眼和耳发育相关的遗传风险位点中,基于TEAD1的机制高度丰富,为HCMV在这些过程中的已知作用提供了机制上的见解。
作者贡献:
项目概念由M.T.W.、L.C.K.、J.B.H.和K.S提出;W.E.M提供TB40/E菌株,M.J.B.、W.E.M.、J.W.和K.S进行细胞培养并启动病毒感染;K.S进行大部分实验;M.H.和C.F.提供实验支持;S.P进行所有初步的信息学和质量控制分析;K.S、S.P、L.A.M.-N.、L.C.K.和M.T.W分析和解释数据;S.P、A.V、L.E.E、O.D.和M.T.W设计并编写用于数据分析的信息学管道;M.M.L.L.和B.Z进行H3K27ac HiChIP实验;L.E.E进行HiChIP分析;O.A.D量化并汇集测序数据。
版本历史:
- 预印本发布:2024年5月22日
- 发送同行评审:2024年8月26日
- 审查预印本版本1:2024年11月27日
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© 2024, Sayeed et al. 本文根据Creative Commons Attribution License分发,允许不受限制的使用和再分发,前提是标明原作者和来源。
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