英国剑桥与美国西雅图，2025年6月12日——据Business Wire报道，Wellcome Sanger研究所、Parse Biosciences以及Helmholtz Munich计算健康中心今日宣布了一项合作，旨在构建一个单细胞图谱的基础，专注于理解和阐明癌症在治疗中的可塑性变化。该合作将推动未来发展阶段，建立一个涵盖数亿个细胞的癌症可塑性图谱。
通过使用新型类器官扰动平台和人工智能（AI）技术，目标是创建一个综合数据集，以推动基础药物发现模型和癌症研究的发展。
Sanger研究所的团队负责人Mathew Garnett博士和Helmholtz Munich计算健康中心主任Fabian Theis教授（同时是Sanger研究所的副教职成员）将成为此次合作的主要研究人员。
Garnett的研究团队开发了新型3D类器官培养技术，这些技术作为高度可扩展且功能强大的癌症模型，能够捕捉患者肿瘤的关键特征。该团队将使用大量的这些肿瘤类器官（即“培养皿中的微型肿瘤”）作为模型，以更好地理解癌症在治疗过程中可塑性和适应性的机制。
Theis的研究团队因其在人工智能与单细胞基因组学交叉领域的复杂生物挑战中开发计算算法而广受认可，特别是在计算机模拟药物对细胞系统影响方面。该计划将通过Parse Biosciences的GigaLab实验室进行，这是一个专为生成大规模单细胞RNA测序数据集而设计的先进设施，具备前所未有的速度。
Sanger研究所、Helmholtz Munich和Parse团队已开发出自动化方法，以简化实验室流程，并提供分析和挖掘此类规模数据集中洞见所需的计算方法。
此次合作的最终目标是构建一个单细胞参考图谱，以实现虚拟细胞建模，并可能帮助预测药物在癌症患者中的效果——包括可能出现耐药性的原因、涉及哪些化合物，以及未来治疗的方向。
Sanger研究所团队负责人及合作共同领导Mathew Garnett博士表示：“我们已经开发了一个变革性平台，能够实现大规模类器官筛选及其下游数据生成和分析，这有潜力重新定义我们对癌症治疗反应的理解。我们的目标是建立一个社区，汇集学术界和工业界的最佳专业知识以推动项目进展。如此规模的研究对于开发基础模型至关重要，有助于我们更好地理解癌症进展并为这一领域带来亟需的进步。”
Helmholtz Munich计算健康中心主任及合作共同领导Fabian Theis教授表示：“随着近期人工智能的进步，我们的虚拟细胞扰动模型愿景正变得越来越可行。但要有效扩展，我们需要大规模高质量的单细胞扰动数据集。这次合作使这种规模成为可能，我对迈向人工智能驱动的实验设计以加速药物发现充满期待。”
Parse Biosciences首席技术官Charlie Roco博士表示：“我们非常兴奋能够将GigaLab的强大能力带给富有远见的合作伙伴。借助Parse的Evercode化学技术，GigaLab可以快速生成大规模的高质量单细胞数据集。结合Wellcome Sanger研究所和Helmholtz Munich的专业知识，以及GigaLab的速度和规模，我们有机会从根本上改变对癌症的理解。”
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