关于本研究主题
提交截止日期
稿件提交截止日期：2026年9月25日
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背景
厌氧细菌——尤其是梭菌属（Clostridium）和类梭菌属（Clostridioides）的成员——是哺乳动物肠道中的主要常住菌群，也是肠道生理的关键驱动因素。它们代谢复杂底物、重塑胆汁酸、产生生物活性代谢物的能力，使其在宿主营养、黏膜屏障功能、免疫教育和定植抵抗中发挥核心作用。同时，梭菌类群包括主要的产毒病原体和条件致病菌，这些菌群在抗生素压力、饮食变化或炎症条件下可能扩增，从而将微生物组紊乱与临床重要疾病结局联系起来。
近年来，厌氧培养、菌株分辨率测序和多组学方面的进展揭示，风险与功能往往存在于菌株水平；微小的遗传差异即可将有益共生菌与毒力或高传播性变异株区分开来。本研究主题将汇集细胞、分子、生态和转化研究，以阐明梭菌及其他厌氧菌如何影响宿主生理和感染易感性，毒力和毒素系统如何出现和持续存在，以及人畜共患或食品/饲料相关途径如何导致人类、动物和环境中的暴露和疾病风险。通过整合临床、兽医和环境视角，本专题旨在支持“One Health”视角下的梭菌生物学——从肠道生态到溢出风险。
为确保强烈的机制性和感染微生物学相关性，我们特别鼓励包含功能验证（例如实验模型、菌株水平的基因组/表型表征，或与宿主反应和疾病终点的明确关联）的投稿，而非仅描述性调查。
我们欢迎涉及以下主题（但不限于）的文章：
- 梭菌属和类梭菌属物种在不同宿主和栖息地中的比较生物学与生态学
- 厌氧菌驱动的代谢网络（例如发酵途径、胆汁酸转化、短链脂肪酸产生）及其对肠道稳态和宿主防御的影响
- 宿主-微生物群相互作用：在厌氧菌存在下塑造黏膜免疫、屏障功能和炎症
- 菌株水平的多样性、适应性和持久性机制（孢子形成、生物膜、应激耐受、生态位竞争）
- 毒力的分子机制、毒素调控以及毒素-宿主细胞相互作用
- 人畜共患传播途径和储存宿主，包括家畜、伴侣动物和野生动物界面，并在可能的情况下结合基因组流行病学和/或毒力/毒素分析
- 食品/饲料相关风险、污染途径和控制策略（从农场到餐桌的全链条），并明确关联感染风险和微生物决定因素（例如孢子、毒素、耐药性或传播性）
- 临床和兽医视角：梭菌感染的诊断、治疗、复发和预防
- 环境驱动因素（废水、土壤、粪便、抗菌药物使用）与“One Health”监测方法，最好整合分离株/菌株表征或机制推断
- 新兴方法和模型（培养组学、厌氧共培养、类器官、悉生动物、多组学）以解决因果机制
- 临床和兽医视角：梭菌感染和中毒的诊断、治疗、复发和预防
- 我们旨在涵盖毒素介导的疾病，这些疾病在医学和兽医角度均高度相关，并与“One Health”方法一致。
文章类型与费用
本研究主题接受以下文章类型，除非研究主题描述中另有说明：
- 简短研究报告
- 社论
- FAIR²数据
- FAIR²数据直接提交
- 一般评论
- 假设与理论
- 方法
- 小型综述
- 观点
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关键词
梭菌属（Clostridium）、类梭菌属（Clostridioides）、厌氧肠道微生物群、胆汁酸代谢、短链脂肪酸（SCFAs）、黏膜免疫、定植抵抗、毒素调控、菌株水平基因组学、One Health监测
重要提示
所有投稿至本研究主题的文章必须符合其提交所在栏目和期刊的宗旨范围，具体以其使命声明为准。Frontiers保留在同行评审的任何阶段将超出范围的手稿引导至更合适的栏目或期刊的权利。
主题编辑
- tomasz grenda（托马什·格伦达）
国家兽医研究所（NVRI）
普瓦维，波兰
- piotr domaradzki（彼得·多马拉茨基）
卢布林生命科学大学
卢布林，波兰
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