杰夫·利克(左)和罗伯特·布拉德利是Synthesize Bio的联合创始人,也是弗雷德·哈钦森癌症研究中心的研究人员。(领英照片)这家总部位于西雅图的初创公司由弗雷德·哈钦森癌症研究中心的领导者创立,宣布获得马德罗纳风险投资集团1000万美元的融资。
这家生物技术公司旨在利用人工智能模拟假设实验室测试的结果,使新药发现过程更快、更经济。该团队构建了名为生成基因组学基础模型(GEM-1)的系统,用于预测基因表达,从而洞察新型药物如何影响细胞行为。
本周二,Synthesize Bio研究人员在bioRxiv平台发表预印本论文,详细阐述该模型及其性能。科学家团队表示,该模型“能以实验室级精度预测未来基因表达实验结果”。
Synthesize Bio拥有一支16人团队,由弗雷德·哈钦森首席数据官杰夫·利克和转化数据科学综合研究中心主任罗伯特·布拉德利于近两年前联合创立。该团队利用公开信息训练模型,这些信息将研究实验与RNA测序数据相关联——RNA测序可捕捉细胞中表达的基因。训练数据集包含来自实验室工作和临床试验的健康及患病人类细胞与组织样本。
马德罗纳管理董事马特·麦克伊尔温在领英平台表示:“这种基础设施转变重新定义了生命科学研发的可能性边界。借助生成基因组学,研究人员能提出更大胆的科学问题,设计更智能的临床试验,并验证此前因成本或技术限制无法探索的假设。”
(Synthesize Bio技术示意图)Synthesize团队在预印本论文中详细阐述了其解决的核心问题:“许多实验室实验的速度受限于细胞生长或疾病发展的自然进程,”公司声明指出,“而临床试验同样受制于受试者招募可行性及保障患者安全的监管要求。”
团队进一步解释,AI模型的生成能力“通过计算模拟大量甚至全部关键实验环节,提供了规避这些基础生物学约束的可能性”。
Synthesize Bio加入西雅图地区蓬勃发展的AI驱动生物技术生态,该区域已聚集多家创新机构:
- 华盛顿大学蛋白质设计研究所(IPD)运用人工智能构建新型治疗性蛋白质,用于应对广泛疾病领域
- 由弗雷德·哈钦森主导的癌症AI联盟,该联盟联合达纳-法伯癌症研究所、纪念斯隆-凯特琳癌症中心和约翰斯·霍普金斯大学,并获得艾伦人工智能研究所(Ai2)与谷歌云支持
- 艾伦研究所西雅图合成中心采用DNA技术记录细胞动态变化过程
- Xaira Therapeutics、Archon Biosciences、Lila Biologics等初创企业集群。仅华盛顿大学蛋白质设计研究所已孵化10家创新企业
预印本论文《生成基因组学准确预测未来实验结果》的其他作者包括:Gregory Koytiger、Alice M. Walsh、Vaishali Marar、Kayla A. Johnson、Max Highsmith、Alexander R. Abbas、Andrew Stirn、Ariel R. Brumbaugh、Alex David、Darren Hui、Jeffrey M. Kahn、Sheng-Yong Niu、Liza J. Ray、Candace Savonen和Stein Setvik。
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