- 自身免疫性溶血性贫血：2型自身免疫疾病。自身抗原：Rh血型抗原，I抗原。后果：补体和吞噬细胞破坏红细胞，贫血。IgG和IgM抗红细胞抗体。2型超敏反应。红细胞溶解或调理作用。
- Goodpasture综合征：2型自身免疫疾病。自身抗原：基底膜IV型胶原的非胶原结构域（抗IV型胶原α3链）。补体介导的细胞损伤。男性多见。IgG呈“线状”分布。后果：肾小球肾炎，肺出血。
- 寻常型天疱疮：2型自身免疫疾病。自身抗原：表皮钙黏蛋白。后果：皮肤起疱。
- 急性风湿热：2型自身免疫疾病。自身抗原：链球菌细胞壁抗原，抗体与心肌交叉反应。后果：关节炎，心肌炎，晚期心脏瓣膜瘢痕形成。
- Graves病：2型自身免疫疾病。自身抗原：促甲状腺激素受体。Th2反应产生自身抗体。抗TSH-R抗体刺激TH产生，导致T3和T4水平升高。后果：甲状腺功能亢进。症状：突眼，代谢率增加，不耐热，神经质，皮肤温暖潮湿，体重减轻，甲状腺肿，易怒。
- 重症肌无力：2型自身免疫疾病。自身抗原：乙酰胆碱受体（抑制性或拮抗性）。后果：进行性肌无力，肌肉收缩受损，眼睑下垂，复视。治疗：胆碱酯酶抑制剂（阻断ACh受体）。
- 2型糖尿病（胰岛素抵抗性糖尿病）：2型自身免疫疾病。自身抗原：胰岛素受体（拮抗剂）。后果：高血糖，酮症酸中毒。
- 系统性红斑狼疮：3型自身免疫疾病（系统性）。自身抗原：DNA（抗核抗体）、组蛋白、核糖体、snRNP、scRNP。后果：肾小球肾炎，血管炎，关节炎。免疫复合物沉积导致关节炎，补体裂解引起炎症，“颗粒状”模式。
- 1型糖尿病（胰岛素依赖型糖尿病）：4型自身免疫疾病。自身抗原：胰岛β细胞抗原。β细胞特异性Th1细胞产生IFNγ，激活巨噬细胞。后果：β细胞破坏。由于身体拥有比所需更多的胰岛细胞，损害累积需要很长时间，大约90%被破坏时才出现症状。食欲增加，尿频。血糖极度升高（葡萄糖代谢紊乱）。β细胞损害先于症状出现。可与柯萨奇病毒蛋白发生交叉反应。
- 类风湿关节炎：4型自身免疫疾病（系统性）。自身抗原：未知的滑膜关节抗原。类风湿因子：IgM抗IgG。Th1细胞激活巨噬细胞。后果：关节炎症和破坏。治疗：抗TNFα。
- 多发性硬化症：4型自身免疫疾病（T细胞介导）。抗原：髓鞘碱性蛋白和髓鞘少突胶质细胞糖蛋白。后果：脑退化，瘫痪，硬化斑块。
- 恶性贫血：2型自身免疫疾病。自身抗体针对胃壁细胞的内因子。抗体阻断维生素B12的摄取。低B12干扰造血作用。
- APECED综合征：自身免疫性多内分泌腺病念珠菌病外胚层营养不良。AIRE基因突变，自身反应性T细胞从胸腺逃逸。AIRE是胸腺中的自身免疫调节因子，使胸腺表达自身肽用于阴性选择。
- IPEX综合征：免疫失调、多内分泌腺病、肠病、X连锁。男孩患病，女孩为携带者。频繁感染。FoxP3基因突变，在胸腺、脾脏和淋巴结中表达。
- 感染A组链球菌与未知的HLA关联，但其后果包括？风湿热（心脏炎和多关节炎）
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