数万亿微生物栖息在人类胃肠道中，它们在维持健康和生物学功能中发挥关键作用：帮助分解食物、吸收营养，并影响免疫系统及其他健康要素。研究人员正在深入探索微生物修饰和生成的生物活性化合物及其对人类健康的影响。
科学家们也在研究免疫系统如何与微生物组相互作用并建立耐受机制。人体通过肠道上皮细胞形成的物理屏障隔离微生物组，同时分泌抗体、蛋白质和黏液等分子来调控肠道菌群，降低病原体感染风险。
最新研究发现，免疫系统对肠道微生物组的适应性达到特定分子水平的相互作用。该研究在小鼠模型中开展，其结论可能适用于人类微生物组。在*《自然》*报道的研究中，科研人员对比了无菌小鼠与正常小鼠的肠道上皮蛋白差异，发现正常小鼠体内APOL9蛋白含量显著升高。这种蛋白主要由肠道上皮细胞产生。
通过高精度细胞分选技术，研究人员发现APOL9及其人类同源蛋白APOL2可特异性结合Bacteroidales类肠道细菌。进一步研究发现，APOL9通过识别细菌表面的神经酰胺-1-磷酸盐（Cer1P）脂质实现精准结合。当细菌缺失Cer1P时，APOL9无法与其结合，这是首个揭示宿主细胞通过细菌脂质特征靶向特定微生物的研究。
APOL9结合细菌后不会直接杀灭细菌，而是促使细菌释放携带外膜囊泡（OMVs）。这些OMVs包含可增强免疫信号的分子，在小鼠模型中，APOL9缺失会导致沙门氏菌感染时免疫应答减弱，而补充OMVs后免疫反应显著增强。
中国科学院钱友存教授表示："APOL9与Cer1P的特异性互作揭示了宿主与微生物组长期共进化形成的分子对话机制。未来我们将重点研究人类APOL2蛋白的功能，并探索调节该通路对增强肠道免疫屏障的潜力。"
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