自“人类微生物组计划”（Nature 569, 641-648，2019）启动以来，肠道微生物群在理解人类健康与疾病方面发挥了重要作用。新的研究表明，微生物组成与生理过程和病理条件之间存在相关性，从代谢紊乱、炎症到神经发育和癌症均受其影响。然而，尽管微生物组研究取得了显著进展，一个持续的挑战仍然存在：如何获得可靠、可重复且具有临床意义的肠道微生物群结构和功能的测量数据。本研究主题题为“肠道微生物群及其对人类健康的重要性——评估微生物肠道功能及其相关病理所需的可靠测量方法”，旨在展示微生物组科学中固有的方法学挑战的最新进展。这些贡献不仅提供了技术见解和创新，还提出了关于标准化、可重复性和转化应用的关键问题。
其中一项研究探讨了口腔和粪便微生物组在室温储存条件下的稳定性，提供了有希望的证据，支持在现实环境中即使无法实现理想储存条件下开展大规模微生物组研究的可行性。这些发现对基于人群的微生物组研究的设计和物流安排具有重要意义。
另一项原创性研究通过小鼠肥胖模型探索了微生物组在δ9-四氢大麻酚（THC）治疗下的动态变化。研究表明，特定细菌特征可以预测体重变化，突显了基于微生物组建模在代谢干预中的潜力。
针对采样技术局限性，一种名为SIMBA胶囊的新型微创设备被引入，该设备能够对小肠微生物组进行精确的时空采样。这一技术创新为研究宿主与微生物组在以往难以触及区域的相互作用开辟了新途径。
此外，一项初步研究进一步探讨了微生物组变化的临床意义，将肠道菌群失调和Faecalibacterium prausnitzii丰度降低与儿童癌症联系起来。尽管是初步结果，但这些发现可能指向早期检测或疾病易感性的潜在微生物标志物。
一项基于人群的研究还揭示，婴儿中的乳酸杆菌定植不仅与年龄和母乳喂养有关，还受到特定HLA单倍型的调控。这些结果为宿主遗传因素对微生物生态的影响提供了关键见解，并直接与益生菌设计和个性化营养策略相关。
为了更深入地理解何为“健康的”微生物组，一篇案例报告探讨了一位粪便微生物群超级供体的复杂微生物架构，展示了成功粪便移植相关的微生物群落特征，强调了高分辨率分类学分析的价值。
最后，一篇综述文章探讨了肠道和粪便pH值作为快速且易于获取的肠道功能生物标志物的潜力。作者认为，通常被忽视的pH值可以作为微生物代谢活动的替代指标，并在临床实践中具有诊断和监测工具的潜力。
总体而言，所有贡献都突出了肠道微生物组研究的多维性质，涵盖从样本处理和新型测量工具到机制洞察和转化视角的方方面面。重要的是，它们都聚焦于一个共同主题：迫切需要可靠且标准化的方法，以确保微生物组数据不仅在科学上稳健，而且在临床上可行。
希望这一特别的研究主题能够激励更多关于微生物组的讨论、创新和临床研究。我们感谢所有作者和审稿人的宝贵贡献，并相信这些工作将成为研究人员和临床医生的重要资源。
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