由志贺菌引起的严重腹泻疾病每年夺去约63,000名儿童的生命。微生物组NG（MicrobesNG）加入了由比尔及梅琳达·盖茨基金会支持的全球科学家联盟，以进一步了解志贺菌感染的规模及其抗生素耐药性在马拉维、孟加拉国、马里、冈比亚、肯尼亚、秘鲁和巴基斯坦七个国家的作用。
每年，近50万名（443,832名）五岁以下儿童死于腹泻疾病，使其成为全球儿童死亡的第三大原因。在这其中，志贺菌病（shigellosis），一种由志贺菌引起的严重腹泻疾病，每年夺去约63,000名儿童的生命。目前，尚无针对志贺菌的疫苗，加之抗生素耐药性的增加（细菌对治疗药物产生抗性），导致低收入和中等收入国家（LMICs）儿童的高死亡率。
为了应对这一紧迫问题，全球联盟（Enterics for Global Health）的任务是更好地了解志贺菌感染的规模及其抗生素耐药性在上述七个国家的作用。
“这个项目是我十年前创立微生物组NG时的希望的完美实现；任何研究团队，无论位于世界的哪个角落，都能获得负担得起的高质量基因组测序服务。”微生物组NG创始人兼首席科学官尼克·洛曼教授表示。
微生物组NG是由伯明翰大学微生物基因组学教授尼克·洛曼十年前创立的测序公司，被选中在该项目中发挥关键作用。微生物组NG将使用先进技术对志贺菌的DNA进行测序，使国际团队能够解码这些遗传信息，更好地了解如何对抗这种疾病。
通过这些数据，并在剑桥大学的凯特·贝克教授和利物浦大学的詹妮弗·科尔尼克博士的支持下，研究团队将识别来自1200多名儿童的志贺菌株的遗传变异，并追踪其传播。最终，这些结果对于制定志贺菌疫苗接种计划至关重要，这将大大减少该疾病的发病率，并影响抗菌药物耐药性的发生率。
凯特·贝克教授，剑桥大学应用微生物基因组学教授，英国卫生安全局分子项目首席研究员表示：“志贺菌一个多世纪以来一直是腹泻疾病的主要原因，现在我们终于能够在疾病最严重的地区集中研究。这项研究将为我们提供所需的信息，找到新的方法来应对这一古老疾病。通过跨国合作，我们可以了解引起疾病的志贺菌的遗传变异，追踪传播，并帮助塑造疫苗接种计划。就像COVID-19一样，随着时间的推移了解遗传变化对于追踪疾病传播至关重要。微生物组NG是我们团队的出色合作伙伴，使我们能够跨国界合作。”
利物浦大学的詹妮弗·科尔尼克博士，该项目的共同首席研究员和马拉维利物浦惠康研究项目的现场负责人表示：“作为工作的一部分，我们将与各国的科学家合作，赋予他们分析和解释数据的能力，提供信息以帮助塑造医疗保健交付和政策。重要的是要记住，每个菌株都来自生病的儿童，最终这些数据将改善实地的治疗效果。”
微生物组NG创始人兼首席科学官尼克·洛曼教授，基因组测序领域的先驱，解释说：“基因组测序是一个非常令人兴奋且迅速发展的领域。在这个项目中，我们从遗传代码中提取信息，以帮助对抗致命疾病。这个项目是我十年前创立微生物组NG时的希望的完美实现；任何研究团队，无论位于世界的哪个角落，都能获得负担得起的高质量基因组测序服务。这将为贝克教授、科尔尼克博士及其团队提供至关重要的信息，以减少这种可怕儿童疾病的负担。”
华盛顿大学西雅图分校的帕特里夏·帕夫林纳博士，EFGH项目的协调首席研究员补充道：“EFGH研究代表了世界各地研究人员之间的一个重要伙伴关系，共同致力于预防志贺菌疾病。借助微生物组NG提供的志贺菌测序数据和数据分析与解释培训，这一子研究有望在我们对全球志贺菌病的理解上产生巨大影响。”
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