当药物研发人员专注于单一候选药物时,会合成大量分子化合物。制药企业通常将这些化合物编目存储在专用库中以备未来筛选,但学术实验室的分子却往往在实验室冷冻柜深处陷入冰冷的遗忘。"你会制作一批化合物进行测试,随后它们就被束之高阁,尽管被仔细分装标记并妥善保存,却只是静静闲置,"伦敦大学学院从事药物发现研究的马修·托德(Matthew Todd)指出。随着时间推移,这些化合物或因降解,或因制备者毕业离校而被丢弃。"所有用于合成这些化合物的工作和资金都白白浪费了。"
作为开源科学倡导者,托德认为这些他称为"闲置分子"(idlers)的化合物可在其他实验室焕发新生。他在《药物化学杂志》发表的论文中,与同事共同提出收集共享这些闲置分子的系统方案,并在补充材料中提供了文库构建、筛选与分析的分步指南(2026年,DOI编号:10.1021/acs.jmedchem.5c02354)。
尽管托德曾参与疟疾和新冠等特定疾病的化合物共享项目,但这是他首次开展非针对特定靶点的普适性计划。他希望该论文能激励更多学术药物发现团队建立并共享自有闲置分子文库,从而形成大规模化合物集合。
托德承认存在若干障碍:令他惊讶的是,能对化合物进行广泛靶点筛选的机构极为稀缺。作为与托德团队合作的一部分,英国卫生安全局已测试96种化合物对多种病原体的活性。他表示将数据上传至PubChem等在线数据库颇为繁琐,但人工智能技术或可简化该流程。
未参与本研究但曾与托德合作的剑桥药物化学咨询公司创始人克里斯·斯温(Chris Swain)评价该倡议颇具价值。他指出,相比制药巨头数百万分子的筛选库,学术化合物文库规模较小,"但任何变革都需要起点"。关于学术药物化学家是否愿采纳此方案,斯温坦言"历史上学者对样本库往往持保密态度",但他认为药物递送领域的研究者将认识到这种开源科学的价值:"软件领域的开源倡议已成熟普及,化学领域若能建立类似机制将意义重大。"
贝萨尼·哈尔福德(Bethany Halford)系波士顿《化学与工程新闻》高级记者。
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