十多年来,科学家们一直满怀希望地测试一类被称为BET抑制剂的癌症药物。其背后的科学原理似乎很可靠。许多肿瘤依赖于在"溴结构域和额外末端域"(BET)蛋白质帮助下被激活的癌基因,因此阻断这些蛋白质有望减缓癌症生长。在实验室实验中,这种方法通常有效。但在真实患者中,结果却远没有那么令人印象深刻,疗效有限,副作用明显,且无法可靠预测哪些患者可能产生反应。
如今,弗赖堡马克斯·普朗克免疫生物学和表观遗传学研究所(MPI-IE)的研究人员认为,他们已经发现了理论与现实之间存在这一差距的关键原因。他们的发现还指出了设计未来治疗方法的更精确途径。
重新思考BET蛋白作为药物靶点
BET抑制剂旨在阻断所有BET蛋白用于附着染色质的共同特征,染色质是DNA和蛋白质紧密包装的结构,基因存储和调控的地方。这个想法很简单:如果你阻止这些蛋白与染色质结合,就可以关闭激活致癌基因的机制。
这一策略基于一个主要假设,即所有BET蛋白行为相似。阿西法·阿赫塔尔(Asifa Akhtar)实验室的新研究表明,这一假设并不成立。该研究表明,两种重要的BET蛋白BRD2和BRD4实际上在基因激活的不同阶段执行不同的任务。
BRD4在过程后期参与其中。它帮助释放RNA聚合酶II,这种酶驱动基因进入活跃转录状态。目前大多数疗法都专注于这一步骤。相比之下,BRD2在更早阶段起作用,帮助组装和组织启动转录所需的分子组件。
基因激活背后的分子"舞台经理"
由于BRD2和BRD4在不同阶段发挥作用,像许多当前药物那样同时阻断两者,会干扰基因激活的多个步骤。这可能导致不可预测且依赖于环境的效果。
"将基因激活比作舞台制作。BRD2搭建舞台:组装道具、服装和演员,确保准备工作顺利进行。然后BRD2向BRD4(即演员)发出'开始'信号,让表演开始,"领导MPI-IE这项研究的阿西法·阿赫塔尔解释道。"先前的研究几乎完全集中在表演上。我们的数据显示,之前的准备工作对基因激活同样至关重要。"
多年来,BRD2被认为不如BRD4重要。新发现挑战了这一观点。其中一个原因是BRD2如何响应细胞内的信号。MOF酶将称为组蛋白乙酰化的化学标记放置在染色质上。这些标记就像一个引导系统,指示哪些基因应该被激活以及BRD2应该从哪里开始工作。
BRD2对这些"书签"特别敏感。当MOF被移除时,BRD2无法再附着在染色质上,而其他BET蛋白则基本不受影响。"这些发现支持这样一种模型:乙酰化的染色质创建了一个平台,允许像BRD2这样的调控蛋白集中并为转录机制做好准备,以便在需要时使用,"阿赫塔尔实验室的第一作者乌穆特·埃尔多杜(Umut Erdogdu)说道。
基因调控中的聚类作用
除了识别这些信号外,BRD2还帮助组织转录机制的物理布局。它在基因位点形成聚类,将必要的组件精确地带到需要开始转录的地方。
"为了了解聚类对基因转录的重要性,我们只移除了BRD2中负责形成聚类的特定部分,而保留了蛋白质的其余部分,"乌穆特·埃尔多杜解释道。
结果非常显著。即使BRD2仍然存在于细胞核中,基因转录速度也几乎与整个蛋白质被移除时一样慢。"这证明聚类不是副作用,而是转录调控的功能特征。就像舞台经理一样,BRD2确保在幕布升起前,每个表演者和每件设备都已就位,"阿西法·阿赫塔尔说。
迈向更精确的癌症疗法
这些见解为癌症药物开发指明了新方向。未来的疗法可以专注于BRD2和BRD4的不同作用,而不是通过它们共同的染色质结合能力广泛阻断所有BET蛋白。
通过更有选择性地靶向这些蛋白质,研究人员可能能够创造出更有效、更可预测的治疗方法。了解每种蛋白质如何促进基因激活,可以帮助改进更符合不同癌症生物学的策略。
关键要点
- 为何一些癌症药物效果不佳:马克斯·普朗克免疫生物学和表观遗传学研究所的研究人员揭示了为何BET抑制剂在临床试验中表现不如预期,尽管早期前景看好。
- 两种蛋白,两种不同工作:研究表明BET蛋白BRD2和BRD4在开启基因方面扮演不同角色。这一关键差异有助于解释为何同时靶向它们可能达不到预期效果。
- 通向更好治疗的路径:目前大多数药物同时阻断两种蛋白。新发现表明,更精确地靶向BRD2和BRD4可能会带来更有效、更可预测的癌症疗法。
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