大规模获取真实世界纵向临床基因组数据

Accessing Real-World, Longitudinal Clinicogenomic Data at Scale

Velsera公司官员表示，该公司已扩展了其全球数据网络（Global Data Network，简称GDN）的功能。他们将GDN描述为一个联邦式、安全的数据生态系统，可使生命科学组织大规模访问并激活真实世界中的纵向临床基因组数据。

据Velsera首席执行官Jamie Littlejohns介绍，GDN覆盖了来自50多家全球数据提供商的超过1.75亿份患者记录，能够整合之前孤立的数据源，包括电子病历（EMR）、基因组学、蛋白质组学、转录组学、病理学和放射学数据，从而加速并提高药物发现和开发的效率。

“传统的数据获取可能需要数年时间——这是行业无法承受的，”Littlejohns说道，“医疗保健行业产生的数据比任何其他行业都多，其对人类的影响也是无与伦比的。然而，令人震惊的是，97%的医疗数据未被使用，超过70%的制药研究数据搜索以失败告终。显然，我们需要一种更好的方式来无缝连接数据与研究人员。”

“GDN使制药和生物技术团队能够在几周内从数据请求转向可操作的洞察——而不是几年——同时确保安全性、合规性和科学严谨性。”

Littlejohns补充道，与集中式模型不同，Velsera的联邦技术允许在符合规定的前提下访问敏感数据集，同时将数据控制权保留在其来源机构手中。他指出，这一结果实现了安全且按需访问多样化高质量数据集，而不会侵犯患者隐私或违反GDPR和HIPAA等监管框架。

大约40%的数据来自美国以外地区，其中欧洲、亚洲和拉丁美洲的代表性正在增长，涵盖了所有主要治疗领域，尤其侧重于肿瘤学、免疫学、神经学和心脑代谢疾病，Littlejohns强调。

定制化数据

GDN专为应对制药行业研发中的一些挑战而设计，包括：

• 靶点和生物标志物发现
• 患者分层和临床试验优化
• 标签和适应症扩展
• 预测模型开发及AI/ML训练
• 伴随诊断和检测开发

Littlejohns指出，约60%的合作利用了临床和组学数据，GDN支持研发过程中广泛高影响力的用例。这些案例包括基于全外显子测序（WES）、全基因组测序（WGS）、RNA测序以及越来越多的蛋白质组学构建的真实世界患者队列——并与经过整理的纵向临床记录相结合。

Velsera的数据科学家和领域专家团队与客户合作，定义、获取并协调合适的数据集。这种以客户为中心的模式使得80%的数据请求在数周内得到满足，大幅缩短了生物制药合作伙伴获得洞察的时间，Littlejohns说道。

为了降低门槛并实现快速假设验证，Velsera提供了灵活的合作模式，从多年的协作到短期访问均可选择。

“我们不仅提供数据，还提供基础设施和专业知识，使这些数据变得可用，”Jamie表示，“而这正是当今研发团队最需要的。”

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