农村和相对贫困驱动非工业化环境中儿童早期肠道微生物组的稳定和多样化发展
在非工业化环境中，关于儿童早期肠道细菌微生物组发展模式和决定因素的纵向数据有限。我们分析了来自厄瓜多尔沿海热带地区一个农村地区的60名儿童从婴儿期到5岁的流行病学数据和粪便样本。收集了大量有关个体、母亲和家庭暴露的纵向数据。通过16S rRNA基因测序分析了粪便样本中的细菌微生物组。α多样性和β多样性指数均表明，在接近5岁时，微生物组特征趋于稳定。更大的α多样性和更低的β多样性与典型的农村贫困因素相关，包括低收入、拥挤居住条件和更多的农业及动物接触。饮用未消毒牛奶始终与更高的α多样性指数相关。分娩方式和妊娠期及儿童早期抗生素暴露对肠道微生物组发展轨迹的影响似乎有限。生活在非工业化环境中，贫困程度较高且通常暴露于农村环境的婴儿似乎在童年期间更快获得了稳定和多样化的肠道细菌微生物组。
结论
在本研究中，我们利用厄瓜多尔沿海地区一个农村地区的出生队列数据，研究了从婴儿期到5岁关键参数的肠道微生物组发育轨迹及其潜在的流行病学决定因素。该队列招募自一个非工业化环境。我们考虑了可能影响发育肠道微生物组的广泛儿童暴露因素。我们的数据显示，生活在贫困条件下，特别是农村贫困环境中，且家庭拥挤、更多农业和动物接触的儿童，其肠道细菌多样性更高，并且更快获得了稳定的肠道微生物组。某些暴露效应在婴儿期最强，而其他效应持续到儿童期。饮用未消毒牛奶始终与更高的细菌多样性相关，而土壤传播蠕虫（STH）感染风险或强烈相关的环境暴露则倾向于降低α多样性测量值，尤其是均匀度。分娩方式和抗生素暴露似乎并未影响这些发育轨迹，这表明在早年生活中，这种“不卫生”但生物多样性丰富的环境可以迅速补偿由这些因素引起的任何缺陷或扰动。
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