识别早期临床试验阶段疗法的益处与不良反应可以提高临床试验的安全性、效率和成本效益。研究人员使用了四个代表不同疾病和药物类别的临床试验（EXSCEL：艾塞那肽/GLP-1 RA，SUGAR-DM-HF：恩格列净/SGLT2i，PRADA：表柔比星/蒽环类药物，AMPLE：阿巴西普/免疫调节剂和阿达木单抗/TNF抑制剂），假设先前验证的心脏代谢结果的蛋白质组学指标可以在更少的参与者和更短的随访时间内检测药物的益处与不良反应。
在EXSCEL试验中（基线对比1年；每周一次艾塞那肽（EQW）(n=1812) 对比对照组(n=1787)）、SUGAR-DM-HF试验中（基线对比12周和36周；恩格列净(n=45) 对比对照组(n=52)）、AMPLE试验中（基线对比85天和1年；阿巴西普(n=210)，阿达木单抗(n=222)）以及PRADA试验中（基线对比7-10天和3个月，n=120），评估了SomaSignal蛋白质组学测试对治疗响应的时间变化。
研究结果显示，EQW对心血管风险和心脏代谢特征的改善在1年内即可检测到（P=.002），样本量显著小于原始研究。恩格列净的心脏保护和肾脏保护作用（P=.06，P=.037）在36周内即可检测到，样本量较小（n≈50）。阿巴西普和阿达木单抗治疗在85天内显著降低了心血管风险（P≤.001，P≤.001）和心肺适能（P≤.001，P≤.001）。相比之下，蒽环类药物治疗在第一个化疗周期后显著增加了心力衰竭死亡风险（P≤0.001）和心血管风险（P=.004）。
这些发现提供了初步证据，表明蛋白质组学可能为优化药物研发流程提供强大工具，通过在规模更小、时间更短的试验中预测新型疗法的效果。
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