一个由覆盖五大洲25个国家的50个科学队列组成的联盟构成了这一倡议的骨干。这一人类微生物组队列联盟将支持全球"一体健康"观测站——这是一个用于在全球范围内收集、整合和分析微生物组数据的新型永久性基础设施。该观测站于2026年4月8日宣布,由INRAE和VIB–KU Leuven共同协调,在Inserm的支持下,将由"世界微生物组伙伴关系"领导。
通过这一联盟,已有近50万人类微生物组得到表征。目标是到2030年达到100万人类微生物组——前所未有的统计覆盖水平——然后从2028年开始将研究范围扩展到包括土壤、海洋和植物微生物组。尽管更为复杂,但这种扩展对于覆盖整个"一体健康"连续体至关重要。
这些努力的目标有二:一是产生可用于研究和创新的知识,二是为政策制定者和公民提供共享的健康指标以及获取基于微生物组的解决方案的途径。
"微生物组既是当今我们面临的最紧迫挑战的驱动因素,也是解决方案:慢性疾病增加、抗微生物药物耐药性、生物多样性丧失、气候变化,以及农业和食品系统的转型。"
——INRAE首席执行官Philippe Mauguin
一千万人类微生物组可能解锁的潜力
由于人类微生物组因饮食模式、农业实践和暴露于污染物等因素而有很大差异,该联盟的一个关键优势在于所收集微生物组的多样性,合作伙伴来自数十个健康和环境背景迥异的国家——包括德国、亚美尼亚、柬埔寨、塞浦路斯、韩国、埃及、西班牙、美国、意大利、日本、墨西哥和新加坡等众多国家。迄今为止,研究面临几个障碍:各国缺乏统一标准、监管框架差异,以及全球南方的研究团队对创新的获取不平等。如今,超过70%的可用人类宏基因组数据来自北美和欧洲。这正是该观测站旨在解决的挑战。
"表征一千万人类微生物组将有助于消除当前障碍——这些障碍既涉及方法论也涉及科学层面,"INRAE国际政策副总裁Thierry Caquet表示。"这种方法的优势在于汇集尽可能多的标准数据。"
这种统计能力可以帮助在全球范围内识别特征、开发早期诊断生物标志物、推进个性化治疗解决方案,并通过人工智能训练大规模预测模型,从而在个性化医学和精准营养领域开辟新前景。同时也有经济价值:2027年基于微生物组的人类健康产品全球市场估计为14亿美元,而农业应用市场(作物生物刺激剂、牲畜微生物添加剂和土壤微生物组恢复)同期估计接近120亿美元。
"这一雄心勃勃的国际项目需要各级——从政府机构到资助机构——的承诺,以支持其发展并促进科学与政策制定之间的对话。"
——Philippe Mauguin
宏基因组鸟枪法测序:法国自2010年以来的专业知识
法国自2010年以来在宏基因组鸟枪法测序的发展中发挥了先驱作用,特别是通过MetaHIT项目(2008–2013),这是一个由欧洲委员会资助、来自八个国家的13个合作伙伴组成的欧洲财团,INRAE担任科学协调员。2010年在《自然》杂志上发表的一篇论文建立了人类肠道微生物组的参考目录,确定了330万个基因——约为人类基因组的150倍。这一资源此后成为后续研究人类微生物组多样性和功能的基础。新的全球观测站建立在法国2030 PEPR SAMS和法国队列计划的基础上,通过"Le French Gut"项目已投入3000万欧元。
将观测站扩展到土壤、海洋和农业生态系统是下一步的逻辑选择。"我们的微生物群深受环境影响,"Thierry Caquet指出。"饮食、化学物质暴露以及与不同程度污染的土壤接触——所有这些都起着作用。微生物在人类、动物、植物、水和土壤之间持续交换。在许多方面,这种相互联系正是'一体健康'方法的核心。"因此,微生物组成为指导公共政策和衡量其影响的有力指标——无论是在减少农业投入、追踪抗微生物药物耐药性、改善土壤健康还是限制污染方面。
世界微生物组伙伴关系
成立于2023年的世界微生物组伙伴关系(WMP)是一个围绕"一体健康"框架内微生物组的全球研究倡议。它汇集了学术界、工业界和公共政策领域的参与者,旨在克服科学和监管障碍,同时加速跨人类、动物和环境健康的应用开发——从生物标志物到干预措施。该伙伴关系由INRAE研究主任Joël Doré担任主席,INRAE研究主任、WMP秘书长Emmanuelle Maguin担任秘书长。INRAE在其发展中发挥核心作用,特别是通过其国际优先计划"微生物组与地球健康",该计划帮助构建了这一合作努力。
PREZODE:世界银行加入预防人畜共患病出现的倡议
世界银行已正式宣布支持PREZODE倡议,特别针对中非和西非地区的项目提供有针对性的支持。与此同时,PREZODE正在显著扩展。亚美尼亚、塞浦路斯、科特迪瓦、印度尼西亚、肯尼亚、利比亚和毛里塔尼亚这七个新国家最近加入,同时伊斯兰开发银行的加入加强了其财务基础。机构伙伴关系也在得到巩固。已与中非经济和货币共同体(CEMAC)、太平洋共同体(SPC)和巴西Fiocruz签署框架协议,使PREZODE在三大洲的区域卫生系统中得到保障。
PREZODE由CIRAD、INRAE和IRD在2021年"一个星球峰会"上发起,现在汇集了280多个成员和观察员,他们共同的目标是预防人畜共患病的出现。该倡议现在是"全球疫情警报和反应网络"(GOARN,由世界卫生组织协调)的一部分。
其治理具有国际范围,依靠汇集来自36个国家的87位专家的主题工作组。这些工作得到与世卫组织、粮农组织和世界动物卫生组织(WOAH)的联合平台的补充,重点关注疾病出现指标、"一体健康"方法的经济价值以及科学-政策-社会对话。
"从一开始,我们就确信只有基于科学的'一体健康'方法才能带来预防未来大流行所需的变革。五年后,PREZODE已达到全球规模,治理涉及90个国家,其中30个国家有部长级参与,在科学与决策之间运作。该倡议现在获得国际认可,已与世卫组织、WOAH和粮农组织开展联合活动,并为重大全球谈判做出贡献。我们致力于其持续扩展,造福所有人和地球。"
——CIRAD、INRAE和IRD首席执行官Élisabeth Claverie de Saint-Martin、Philippe Mauguin和Valérie Verdier
"问题不是是否会发生另一场大流行,而是何时——以及在哪里,"Thierry Caquet说。在过去的三十年中,已确定了30多种新的人类病原体,其中四分之三来自动物。埃博拉、尼帕病毒、禽流感和COVID-19是最广泛记录的病例。
这些出现事件是由汇聚的压力驱动的。森林砍伐、农业扩张和城市化正在减少野生动物栖息地,而气候变化正在重塑物种分布。结果,野生动物、牲畜和人类种群之间的互动正在加强,增加了从先前隔离的生态系统中溢出事件的可能性。据估计,目前有170万种未知病毒在野生动物中传播。如果不彻底改变预防策略,它们可能引发的大流行预计将比COVID-19更频繁地发生、更快地传播并造成更大的死亡率——这是IPBES专家在2020年已经发出的警告。
在塞内加尔东南部的凯杜古地区(野生动物、牲畜和人类种群互动频繁),AFRICAM项目正在实施兽医卫生培训和支持计划。
然而,预防对公共政策提出了结构性悖论。"预防本质上是无形的,"Thierry Caquet指出。"只要没有危机发生,它可能看起来是一项不合理的成本;当危机确实发生时,它的缺失变得显而易见。"据IPBES称,大流行的经济成本可能比预防措施高出100倍。
在实地,基于社区的"一体健康"监测系统已通过PREZODE在16个中低收入国家投入运行。这些活动得到法国开发署(AFDA)通过PREACTS计划提供的2500万欧元支持,该计划在非洲、亚洲和南美洲资助15个项目。
同时,九个PEPR研究项目——额外2500万欧元——正在法国(包括海外领地)以及国际上进行。PREZODE还积极参与围绕《国际大流行预防、准备和应对协议》的谈判,倡导南北共同立场,并在其成员国中启动了"一体健康"机制的全球清查。
微生物组观测站和PREZODE这两项倡议都根植于相同的"一体健康"愿景——这是INRAE战略的核心——并反映了应对这些挑战的规模转变。正如Thierry Caquet所观察到的,它们的国际维度使得"围绕共同框架汇集科学界,提出新的研究问题,并开发任何单一机构都无法独自开展的项目"成为可能。同时,它们将研究置于直接与公共政策相连的行动导向机制中。"我们不是为了'一体健康'而追求它,"Thierry Caquet强调。"我们这样做是因为人类社区直接相关。"从这个意义上说,预防不仅是一个科学目标,而且是一个可衡量和可治理的公共产品。
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