肠道微生物系统包含多达5000种微生物，分为有害或致病菌群和促进健康菌群。若微生物失衡，可能导致身体出现某些异常。饮食习惯和食物种类影响微生物状态，如果长期重复摄入同类食物或垃圾食品，可能导致身体无法获得微生物所需的全面营养，尤其是对微生物至关重要的益生元。通过肠道微生物组检测，可以分析超过100种菌株，并评估与9种疾病相关的风险。
人体由超过100万亿个细胞组成，但真正的人类细胞仅有30万亿个，其余100多万亿个细胞是微生物细胞，它们分布在皮肤、口腔、阴道等部位，其中以消化道（尤其是肠道）最多，种类达5000种。
微生物包括细菌、病毒、真菌和寄生虫，它们以共生方式存在。有些有助于预防疾病、促进新陈代谢、消化和排泄；有些则能合成身体必需物质、增强免疫系统。与此同时，某些身体异常也可能源于微生物失衡。因此，科学家研究微生物的遗传密码（即微生物组），以确定其种类、数量及其与宿主器官的关系，这对健康管理、疾病预测、治疗方案选择及未来疾病预防都有重要意义。
肠道微生物种类和数量的多样性决定了它们发挥的不同重要作用。微生物分为两类：
- 有害或致病菌：通过体内产生毒素引发疾病，如幽门螺杆菌（Helicobacter pylori）可导致胃病、增加胃溃疡、胃肿瘤和胃癌风险；某些大肠菌群或肠道细菌则与结直肠癌、慢性肠炎、肥胖、心脏病、类风湿性关节炎、脂肪肝、肝硬化及肝癌相关。
- 促进健康菌群：是身体所需的微生物，例如乳酸杆菌（Lactobacillus）能抑制并阻止致病菌生长；真杆菌（Eubacteria）/双歧杆菌（Bifidobacteria）有助于合成所需营养素、形成防御屏障、激活免疫系统，并帮助消化或吸收营养。
若肠道微生物失衡，会对健康产生如下影响：情绪波动、抑郁或焦虑、肥胖、皮肤病（如湿疹）、心血管疾病、糖尿病、癌症、肝病、口腔健康问题（如蛀牙）。
肠道微生物组检测可通过粪便样本分析体内好坏菌群的平衡，帮助了解微生物密度、多样性是否足够，以及微生物对身体的整体影响。若检测发现密度、多样性和有益性均处于失衡状态，则疾病风险高于平衡状态。该检测有助于医生评估疾病风险，并诊断可能因肠道微生物失衡引起的疾病，如肠易激综合征、肥胖、糖尿病、偏头痛、焦虑症和抑郁症。
通过益生菌和益生元以及行为调整来重建肠道平衡：国际IASD协会建议成年人睡眠6-8小时，充足睡眠有助于身体休息减压，使肠道环境比睡眠不足或长期失眠更健康；定期运动超过每天30分钟、每周3-5次，可增强肠道免疫，减少有害细菌生长并增加微生物多样性；减少加工肉类和即食食品摄入；减少辛辣、过咸或重口味食物；减少高脂肪和高碳水化合物食物；同时摄入益生菌（有益微生物）和益生元（为有益菌提供养分的物质），以增强免疫力并调节肠道功能。但一次摄入大量益生菌可能引起腹胀、便秘或腹泻等副作用，应咨询医生以确定适当剂量。
肠道微生物失衡状态：健康的微生物群有助于形成黏液层，为上皮细胞提供屏障，使有害细菌无法穿透肠壁。若有益菌失衡，这些过程可能缺失，从而增加某些疾病的发生几率，如炎症性肠病（IBD）和肠易激综合征（IBS），这些疾病与微生物失衡、致病菌增多以及抗生素使用有关，导致致病菌能穿透上皮细胞，引发炎症并增加消化道疾病风险。
肠道微生物失衡可能导致以下疾病风险：
- 吸收不良综合征：正常情况下肠道有益菌正常工作时不引发症状，但腹部手术、糖尿病、硬皮病、胃或肠切除后，肠道细菌平衡改变，致病菌过度生长，可能导致脂肪、碳水化合物、蛋白质及维生素B12的吸收异常。
- 艰难梭菌感染（CDI）：正常情况下，肠道中存在次级胆汁酸合成菌，它们将初级胆汁酸转化为次级胆汁酸，抑制艰难梭菌生长，使其无法分泌导致肠上皮炎症和腹泻的毒素。使用抗生素时，除杀灭坏菌外，也会破坏这些合成菌。因此若感染艰难梭菌，其生长后会分泌毒素，导致肠上皮炎症。
- 炎症性肠病（IBD）：相关因素包括遗传、免疫和环境（饮食）。正常情况下，体内有益菌如拟杆菌（Bacteroides）和厚壁菌（Firmicutes）具有抗炎作用，并能形成黏液层阻止病原体穿透消化道。若遗传和免疫异常，会导致组织炎症，细菌多样性降低，致病菌释放毒素，引发肠道炎症。
- 肠易激综合征（IBS）：有多种类型，取决于致病菌种类。检测特定细菌类型有助于精准治疗。例如肠杆菌科（Enterobacteriaceae）是导致消化道感染的坏菌；乳酸杆菌（Lactobacillus）能通过发酵双糖产酸，可能引起腹痛和腹胀；拟杆菌（Bacteroides）常见于腹泻型IBS患者；而双歧杆菌（Bifidobacterium）和粪杆菌（Faecalibacterium）则是有益菌，能产生抗炎物质。
- 肥胖与代谢综合征：肥胖是体内脂肪过多，尤其是腹部内脏脂肪，可引发全身炎症，炎症导致胰岛素抵抗，增加糖尿病风险。克里斯滕森菌（Christensenellaceae）有助于调节肠道菌群，预防内脏脂肪、高血脂、代谢综合征和糖尿病。此外，肥胖者体内阿克曼菌（Akkermansia muciniphila）数量较少，这种“瘦菌”能刺激黏液生成，强化肠壁并抵抗肠道炎症。
- 与红肉摄入相关的心血管疾病：双歧杆菌（Bifidobacterium）和脱卤杆菌（Dehalobacterium）能刺激身体产生有益营养素。但若同时摄入富含磷脂酰胆碱的红肉，且肠道中存在坏菌如梭菌科（Clostridiaceae）和奈瑟菌科（Neisseriaceae），它们会将胆碱转化为三甲胺（TMA），TMA被吸收后经肝脏代谢为氧化三甲胺（TMAO），这是导致心血管疾病风险的重要因素。肠道菌群检测可初步评估因红肉摄入导致的心血管疾病风险。
- 结肠息肉：研究发现，结肠息肉患者体内的梭杆菌（Fusobacterium）数量是正常人的415倍，这种菌会抑制对抗癌症的免疫系统，特别是抑制自然杀伤细胞（NK细胞）的功能。
- 糖尿病：肠道微生物帮助分解人体无法消化的某些膳食纤维，通过发酵产生短链脂肪酸，刺激胰腺β细胞合成和分泌胰岛素，从而降低胰岛素抵抗，减少血液炎症，并减少肠漏症的发生（肠漏也会引发全身炎症）。具有这些特性的细菌包括双歧杆菌（Bifidobacterium）、罗斯菌（Roseburia spp.）和普氏粪杆菌（Faecalibacterium prausnitzii）。
人体微生物的差异：不同年龄段有不同的微生物模式；胎儿在子宫内处于无菌环境，来自母体微生物的信号会传递给胎儿，若母亲压力大、服药或饮食不当，会影响其微生物进而影响胎儿；分娩方式：顺产婴儿获得更多乳酸杆菌（Lactobacillus），剖腹产婴儿则葡萄球菌（Staphylococcus）增多；母乳喂养的婴儿双歧杆菌（Bifidobacterium）和乳酸杆菌增加，开始使用奶瓶后，拟杆菌（Bacteroides）和梭菌（Clostridium）增多；当开始成人饮食并使用抗生素时，微生物的种类和多样性会发生变化。饮食和食物种类对微生物影响显著，重复摄入同类食物或垃圾食品会导致微生物所需营养不足，尤其是重要的益生元。运动和地理环境也有影响，居住地关联着促进有益菌的食物，如泡菜、鱼露、纳豆等，这些在亚洲地区比欧洲更常见。
警示肠道微生物可能失衡的迹象包括：消化道异常或肠易激综合征（如腹胀、消化不良、恶心、呕吐、腹泻或便秘）；偏头痛或失眠；痤疮；反复发作的过敏性皮疹；哮喘；新陈代谢不佳；有焦虑症、抑郁症、肥胖、2型糖尿病和阿尔茨海默病的风险；口臭；粪便中有黏液；长期使用抗生素；碳水化合物不耐受；疲劳乏力；长期使用抗酸药；鼻塞。若出现上述症状至少5项或更多，可能存在肠道微生物失衡。
采用下一代测序（NGS）技术检测的优势：可分析超过100种菌株，用于后续患者管理；能对比致病菌和有益菌的种类；可分析与9种疾病相关的风险：肥胖、肠易激综合征、糖尿病、高胆固醇、与红肉摄入相关的心血管疾病、结肠息肉、抑郁症、类风湿性关节炎和年龄相关性黄斑变性。
接受肠道微生物组检测前的准备：无需禁食禁水；检测前约3天停用抗生素。维持肠道微生物平衡对促进健康和降低多种疾病风险至关重要，建议摄入有益、清洁、无污染的食物，减少抗生素使用或仅在必要时使用。增加富含益生菌和益生元的食物，并定期进行肠道微生物检测（建议在行为调整或遵医嘱后每6个月复测一次），因为微生物模式会随因素变化而改变。
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