关于本研究主题
背景
厌氧细菌——尤其是梭菌属和艰难梭菌属的成员——是哺乳动物肠道中的主要定居者，也是肠道生理的关键驱动因素。它们代谢复杂底物、重塑胆汁酸以及产生生物活性代谢物的能力，使其在宿主营养、黏膜屏障功能、免疫教育和定植抗性中发挥核心作用。同时，梭菌谱系包括主要产毒病原体和条件致病菌，这些菌株在抗生素压力、饮食改变或炎症条件下可能扩增，从而将微生物组紊乱与临床重要的疾病结局联系起来。
近年来，厌氧培养、菌株分辨测序和多组学技术的进展表明，风险和功能往往存在于菌株水平，微小的遗传差异即可将有益共生菌与毒力强或高传播性的变体区分开来。本研究主题将汇集细胞、分子、生态和转化研究，阐明梭菌及其他厌氧谱系如何影响宿主生理和感染易感性，毒力和毒素系统如何出现和持续存在，以及人畜共患或食物/饲料相关途径如何导致人类、动物和环境的暴露和疾病风险。通过整合临床、兽医和环境视角，该文集旨在支持一体化健康观点下的梭菌生物学——从肠道生态到溢出风险。
为了确保与机制和感染微生物学的强相关性，我们特别鼓励提交包含功能验证的研究（例如，实验模型、菌株水平的基因组/表型表征，或与宿主反应和疾病终点的明确关联），而非仅描述性调查。
我们欢迎涉及以下主题的文章，但不限于此：
- 梭菌属和艰难梭菌属物种在不同宿主和栖息地中的比较生物学和生态学
- 厌氧菌驱动的代谢网络（例如，发酵途径、胆汁酸转化、短链脂肪酸产生）及其对肠道稳态和宿主防御的影响
- 宿主-微生物群相互作用在厌氧细菌存在下塑造黏膜免疫、屏障功能和炎症
- 菌株水平的多样性、适应和持久性机制（孢子形成、生物膜、应激耐受、生态位竞争）
- 毒力的分子机制、毒素调控及毒素-宿主细胞相互作用
- 人畜共患传播途径和储存宿主，包括牲畜、伴侣动物和野生动物界面，尽可能结合基因组流行病学和/或毒力/毒素谱分析
- 食物/饲料相关风险、污染途径及从农场到餐桌全链条的控制策略，明确与感染风险和微生物决定因素（如孢子、毒素、耐药性或传播性）的联系
- 临床和兽医视角下的诊断、治疗、复发和预防梭菌感染
- 梭菌传播的环境驱动因素（废水、土壤、粪肥、抗菌药物使用）及一体化健康监测方法，理想情况下整合分离株/菌株表征或机制推断
- 新兴方法和模型（培养组学、厌氧共培养、类器官、无菌动物模型、多组学）以解析因果关系和机制
- 临床和兽医视角下的诊断、治疗、复发和预防梭菌感染及中毒
- 我们旨在纳入毒素介导的疾病，这些疾病从医学和兽医角度看都具有高度相关性，并与一体化健康方法一致。
文章类型和费用
本研究主题接受以下文章类型，除非研究主题描述中另有说明：
- 简要研究报告
- 社论
- FAIR²数据
- FAIR²数据直接提交
- 一般评论
- 假设与理论
- 方法
- 小型综述
- 观点
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关键词
关键词： 梭菌属，艰难梭菌属，厌氧肠道微生物群，胆汁酸代谢，短链脂肪酸，黏膜免疫，定植抗性，毒素调控，菌株水平基因组学，一体化健康监测
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主题编辑
- tomasz grenda，国家兽医研究所（NVRI），波兰普瓦维
- piotr domaradzki，卢布林生命科学大学，波兰卢布林
影响
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