【纽约，纽约州 2025年10月1日】——纽约西奈山伊坎医学院、波士顿医学中心和波士顿大学乔巴尼扬与阿韦迪西安医学院的研究人员开发了一个软件平台，帮助科学家更轻松地分析健康和疾病状态下组织的分子结构。该平台名为Giotto Suite，相关细节已发表在10月1日在线出版的《自然·方法》期刊上。
近年来，新技术使得捕获完整组织内RNA和蛋白质的详细图谱成为可能——这一领域被称为空间组学。这些进展为了解细胞在不同组织微环境中的行为和相互作用提供了宝贵见解，这对于理解癌症、神经退行性疾病和免疫系统疾病等状况尤为重要。
西奈山伊坎医学院遗传学与基因组科学教授、共同高级通讯作者袁国成（Guo-Cheng Yuan）博士表示：“虽然空间组学技术正在生成关于组织分子景观的极其丰富的数据，但现在的真正挑战在于分析和解释这些数据。最大的障碍不再是生成信息，而是理解这些信息。生物学家需要能够跟上这些数据集日益增长的复杂性和规模的工具，并帮助他们得出有意义的结论。我们想要创建的工具不仅简化分析过程，还能适应不同类型的空间数据和工作流程，使研究人员能够专注于科学而非技术障碍。”
为满足这一需求，研究团队创建了Giotto Suite，这是一套基于R语言（一种广泛用于数据分析的编程语言）构建的模块化软件工具。该工具旨在与任何平台的空间数据协同工作，并支持广泛的分析，包括不同类型测量和分辨率的数据整合。研究人员表示，其灵活的结构还允许用户根据研究需求从多个起点开始分析。
波士顿大学乔巴尼扬与阿韦迪西安医学院医学、血液学和医学肿瘤学助理教授、波士顿医学中心和波士顿大学再生医学中心副研究员、共同高级通讯作者鲁本·德里斯（Ruben Dries）博士表示：“许多现有工具要求用户组合多个软件包以完成完整分析。该工具将这些步骤整合到单一框架中，旨在简化流程。我们还考虑到可扩展性，以适应空间数据集日益增长的规模和复杂性。我们的目标是开发一个帮助其他研究人员从其空间数据中发现新见解的平台。”
研究人员警告称，当前版本仅包含可用分析方法的子集，可能不适合所有研究问题。然而，他们强调，该平台旨在不断发展，他们计划继续扩展其功能，增强与外部软件包的互操作性，并为研究社区提供培训和支持。
展望未来，研究人员计划在自身对癌症和神经退行性疾病的研究中应用Giotto Suite，同时根据科学界的反馈继续完善该工具。该工具可免费提供给研究人员使用，团队希望这将促进生物医学研究中空间组学技术的更广泛应用。
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