本文发表于《神经元》期刊,林·范·奥尔斯特与大卫·盖特评述了Reid团队的突破性研究。Reid等人在本期《神经元》中介绍了MultiVINE-seq技术——一种用于人类脑血管及血管周围细胞配对转录组和表观基因组分析的单细胞核多组学平台。通过整合全基因组关联研究数据,研究者将神经退行性和脑血管疾病的风险基因变异精准定位至特定血管与免疫细胞类型,揭示了不同的致病通路及其交汇点。
图1 MultiVINE-seq将遗传风险映射至人类神经血管及免疫细胞类型
(A)从背外侧前额叶皮层分离细胞核并进行单细胞核RNA测序/ATAC测序配对分析的工作流程。
(B)跨15种实质性和血管/血管周围细胞类型的约6.6万个细胞核完成图谱绘制;结合约3.9万个全基因组关联研究变异数据,成功将2605个此前未定位的变异映射至细胞类型特异性调控元件及关联基因。
(C)脑血管疾病相关变异在成纤维细胞和壁细胞中汇聚于细胞外基质基因,而神经退行性疾病相关变异则在小胶质细胞、血管周围巨噬细胞和T细胞中汇聚于适配器基因,包括CD8+ T细胞中一个与阿尔茨海默病相关的PTK2B增强子变异。
缩写说明:MultiVINE-seq(多组学血管及免疫细胞核提取测序);snRNA-seq(单细胞核RNA测序);ATAC-seq(转座酶可及染色质测序);dlPFC(背外侧前额叶皮层);GWAS(全基因组关联研究);ECM(细胞外基质);PVMs(血管周围巨噬细胞);AD(阿尔茨海默病)。
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