新冠检测策略革新药物与化学发现新途径New research: How a COVID-era trick may transform drug, chemical discovery | Department of Chemistry and Chemical Biology

环球医讯 / 创新药物来源:www.chemistry.harvard.edu美国 - 英语2026-01-22 13:05:42 - 阅读时长4分钟 - 1762字
哈佛大学与默克公司研究人员创新性地将新冠疫情时期的群体检测策略应用于化学催化领域,开发出混合测试与解卷积算法相结合的新框架,可高效识别催化剂间的协同作用,大幅减少实验次数达90%以上,加速药物分子和绿色化学品的研发进程,该方法通过优化钯催化脱羰基交叉偶联反应验证成功,为可持续化学和精准制药开辟新路径,有望显著降低贵金属催化剂用量并推动高通量实验设计的范式转变,相关成果发表于《自然》期刊并获美国国立卫生研究院资助。
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新冠检测策略革新药物与化学发现新途径

2020年新冠检测试剂短缺期间,实验室转向了一种巧妙的变通方法。他们将多名患者的样本混合后进行单一测试:若结果为阴性,则所有人在一次测试中即被排除感染;若为阳性,则通过后续测试精准锁定感染者。这种被称为群体检测的策略节省了宝贵的时间、金钱和资源。

如今,哈佛大学化学与化学生物学系的埃里克·雅各布森(Eric Jacobsen)教授团队联合默克公司科学家,将相同核心理念应用于加速药物及其他高价值化学品的生产流程。

在《自然》期刊发表的新论文中,由化学与化学生物学系Sheldon Emery化学教授埃里克·雅各布森领导的团队,描述了一种实验与计算框架。该框架采用混合测试方法,用于探测催化剂之间的协同作用——催化剂是能加速化学反应并降低反应物转化为产物所需能量的物质。此方法在揭示高效组合的同时,显著减少了化学家需要运行的反应次数。

雅各布森表示:"将两种不同催化剂组合以观察其是否产生特殊强大效果——无论是在反应活性还是选择性方面——这一理念长期以来令我及众多化学家深感兴趣。我们现已找到一种高效途径,用于揭示意料之外的协同作用表现形式。"

"我们现已找到一种高效途径,用于揭示意料之外的协同作用表现形式。"

埃里克·雅各布森

化学家早已知晓,两种催化剂有时能协同作用,产生更高产率、更纯净产物,或实现单组分无法达成的温和反应条件。然而即使测试少量潜在候选物,计算量也急剧膨胀:例如50种潜在催化剂组成的组合池,包含超过1,200个独特配对,更不用说三元或四元组合。

为克服此局限,研究人员从群体检测中汲取灵感。在公共卫生领域,目标是以最少测试识别最多感染者;而在本项新研究中,测试旨在发现使反应异常高效或高选择性的催化剂配对。

论文第一作者、肯尼斯·C·格里芬文理研究生院(Kenneth C. Griffin Graduate School of Arts and Sciences)博士生马库斯·萨克(Marcus Sak)表示:"我们采用了源自新冠检测的思路。能否利用简单数学与统计学,创建一种几乎无需了解系统化学特性的发现算法?"

团队设计了混合实验:每个反应按特定模式包含多个催化剂候选物。定制算法随后分析各混合池的性能表现,并据此推断出导致性能提升或下降的具体配对组合。

雅各布森强调:"这不仅是简单混合与测试,更涉及大量统计分析。我们成功开发出可预测最佳混合策略的代码,用于评估不同催化剂组合。"

"我们成功开发出可预测最佳混合策略的代码,用于评估不同催化剂组合。"

埃里克·雅各布森

然而存在关键挑战:与新冠检测中样本仅有阴阳性不同,真实化学系统复杂多变。某些催化剂起促进作用,某些起抑制作用,许多甚至兼具双重效应,具体取决于反应容器中的其他成分。

雅各布森解释道:"催化剂既能相互协同,也会相互抑制。若问'既然协同作用如此重要,为何不将所有催化剂投入一个容器观察效果?'问题在于:若将已知催化剂全混为'化学汤',必然得到无效混合物——它们会相互抵消。"

为确保混合-解卷积策略的准确性,研究团队首先在模拟数据上验证。该算法始终能精准识别真实协同配对,同时过滤误导信号。

受此鼓舞,团队将化学与化学生物学系助理教授理查德·刘(Richard Liu)提出的现实挑战作为测试场:钯催化脱羰基交叉偶联反应。此类反应是构建复杂分子(包括潜在药物候选物)的核心工具。

算法成功识别出多个性能超越单个配体的配体组合。降低催化剂用量和能耗是可持续化学的关键目标,尤其涉及贵金属时。但作者强调,该框架的价值远超单一反应转化。

雅各布森指出:"我认为这与理性设计方法形成有力互补——后者依赖机理理解来实现预期效果。"

展望未来,研究团队计划突破二元配对,探索三元及以上高阶协同作用,即三种或更多催化剂或配体的协同作用。

雅各布森总结道:"通过高通量实验与战略分析,开发寻找有趣化学现象(如本例中的协同作用)的有力策略,将释放巨大潜能。未来数年,我们将发现大量新化学知识。"

本研究获美国国立卫生研究院和国家科学基金会部分资助。

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