饮食和营养是人类肠道微生物组组成和功能的主要决定因素。尽管该领域已取得重大进展，科学家们仍未找出如何基于个体肠道微生物组实现营养个性化，以及确定可指导个性化饮食建议的饮食-微生物组关联。
一项新研究在10,068人的队列中发现了经过验证的物种级、食物特异性关联，这些发现可能有助于指导个性化营养。
研究人员分析了来自"人类表型计划"(Human Phenotype Project)的10,068名主要健康的以色列成年人的饮食-微生物组关联，这是全球规模最大、最深入的多组学表型研究。研究使用基于应用程序的饮食记录和鸟枪法宏基因组学进行分析。基线分析纳入了7,998名参与者，测试集包含2,070名参与者。其中，1,654名参与者进行了2年随访，1,412名参与者进行了4年随访。为进行外部验证，研究人员还分析了来自两个独立队列的数据（澳大利亚，n=118；以色列，n=188）。
研究量化了特定食物、整体饮食模式与肠道微生物组之间的关联。当将年龄、性别、身体质量指数和合并症作为协变量时，饮食可预测92%的肠道菌种（测试的724种菌种中的669种）和98%的微生物通路（320条通路中的313条）。最小加工、富含营养的食物摄入是微生物α多样性的最强正向预测因子。然而，超加工食品是微生物多样性的最强负向预测因子。结果表明，食物加工对微生物多样性的影响比饮食主要是动物性还是植物性更强。
研究确定了不同的特定食物-微生物关联，包括咖啡与产丁酸盐的Lawsonibacter asaccharolyticus、酸奶与Streptococcus thermophilus、乳制品和面包与Bifidobacterium longum和B. adolescentis的正相关。Lachnospiraceae和Clostridium家族中特定物种的丰度与坚果和香蕉的摄入量密切相关。纵向分析显示，一些饮食-微生物组关联在4年内持续存在。
研究人员还构建了一个探索性框架，用于模拟基于微生物组预测变化的个性化饮食干预。例如，Akkermansia muciniphila和Faecalibacterium prausnitzii是预测会随着包含一种或两种食物变化（如减少白面包和增加坚果）的饮食改变而变化的肠道细菌中最常见的，且与心脏代谢标志物独立相关。
总之，这些发现突显了基于个体肠道微生物组的个性化营养策略的潜力。这意味着，如果临床医生知道患者哪些分类群失调以及哪些食物和饮食模式调节这些分类群，就有可能提供个性化饮食建议，而非泛泛的生活方式指导。要从观察走向处方，个性化营养需要随机试验来测量肠道微生物组对靶向微生物组饮食的反应变化。
参考文献：
Segev T, Barak D, Zahavi L, et al. 人类表型计划中10,068名个体的饮食-微生物组关联指导个性化营养。Nat Med. 2026; 32(5):1884-1894. doi: 10.1038/s41591-026-04312-x.
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