英矽智能（"Insilico"），与华东医药公司的研究伙伴合作，今天宣布发现了一种新型小分子抑制剂，能够有效靶向WD重复蛋白5（WDR5）-MYC蛋白-蛋白相互作用。这项研究利用了英矽智能的开创性生成式人工智能（AI）和基于物理的分子建模模块，并发表在《化学生物学与药物设计》期刊上。
MYC蛋白是一种已知的致癌驱动因子，存在于高达70%的人类癌症中，但由于缺乏合适的结合口袋以供高亲和力小分子抑制剂结合，长期以来被认为“不可成药”。然而，最近的研究表明，MYC与WD重复蛋白5（WDR5）之间的相互作用对于MYC的致癌活性至关重要，从而为药物开发提供了一个有前景的新治疗靶点。
研究团队最初使用生成式AI支持的Chemistry42平台生成针对WDR5的小分子抑制剂。通过应用基于配体的分子生成技术和引入锚定点以保留关键药效团，团队发现了化合物8（IC50 = 16.35 μM）和化合物9（IC50 = 1.91 μM）。这两种化合物与参考化合物（IC50 = 20.86 μM）相比，表现出显著提高的抑制活性。
他们进一步利用Chemistry42的基于物理的工具AlChemistry对这些命中化合物进行了优化，以创建具有亚微摩尔结合亲和力的先导化合物。其中一种先导化合物9c-1，与化合物3相比，活性提高了35倍，达到了亚微摩尔结合亲和力。这一分子标志着一个重大进展，成为开发有效WDR5-MYC蛋白-蛋白相互作用抑制剂的有希望候选物。
“这项研究再次证明了我们的AI驱动平台如何能够快速解锁药物发现中的新可能性，特别是对于那些以前被认为不可成药的目标，”英矽智能的化学与DMPK负责人兼药物化学高级副总裁丁晓博士说。“这项研究的积极结果不仅展示了生成化学模块与基于物理的建模模块相结合的力量，还展示了其将尖端科学转化为有前途的治疗候选物的真正潜力，以满足患者的高医疗需求。”
英矽智能在2016年首次在同行评审的期刊上描述了使用生成式AI设计新型分子的概念，随后继续开发了商业可用的Pharma.AI平台。通过整合尖端AI和自动化技术，英矽智能在早期药物发现和开发过程中实现了显著的效率提升，相比传统药物发现方法通常需要2.5至4年的时间，英矽智能在2021年至2024年的22个内部药物候选项目的关键时间线基准中展示了卓越的表现，平均时间线到DC仅为12至18个月，每个项目合成了60至200个分子并进行了测试。
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