微生物组已成为现代医学中最大的战场之一。
其前景极为广阔：早期疾病检测、个性化营养、预防为主的医疗护理，以及对人类生物学的深入理解。然而，许多胃肠病学家仍面临着临床效用不明确、缺乏可行建议的色彩斑斓的微生物组报告。
Viome公司联合创始人兼发现AI部门负责人Guruduth Banavar，以及Viome公司全球医疗总监Michael Bass博士，与我以及联合主持人Connecticut GI首席信息官、GI Alliance创新委员会主席Neil Parikh博士，以及Virgo创始人兼CEO Matt Schwartz进行了讨论。
我们探讨了为什么临床医生对微生物组检测持怀疑态度、宏转录组学与传统方法有何不同，以及当生物学变得可测量而疾病尚未显现时会发生什么。
- "微生物组既被过度炒作，又未得到充分利用。"
Parikh博士认为微生物组科学前景广阔，但大多数胃肠病学家仍缺乏在患者护理中使用微生物组数据的可行方法。
- 大多数微生物组科学可能建立在过时的技术之上。
Guru解释了为什么绝大多数微生物组研究仍依赖16S测序，以及为什么宏转录组学等新方法可能提供更具临床意义的图景。
- 该领域可能在测量错误的东西。
传统微生物组检测关注的是哪些微生物存在。而宏转录组学则关注这些微生物在肠道内实际在做什么。
- 胃肠病学可能已在微生物组医学方面落后。该行业能否实现跨越式发展？
Bass博士认为，许多临床医生从未学习过从16S测序到宏转录组学的演变，导致研究与临床实践之间的差距越来越大。
- 长寿诊所可能比传统胃肠病诊所发展更快。
Parikh博士指出，长寿医学和直接初级护理领域已经在拥抱微生物组驱动的个性化医疗，而大多数胃肠病学仍持谨慎态度。
- 微生物组指导的营养能否改善IBS结果？
Guru分享了一项安慰剂对照研究的数据，并讨论了基于微生物组的方法如何能够超越当前肠易激综合征管理的试错治疗模式。
- 分子生物学正成为一个AI问题。
Guru解释了Viome的AI如何分析分子数据而非文本或图像，将数百万核苷酸读数转化为生物通路和个性化建议。
- 胃肠病学中下一个AI突破可能来自融合。
Matt Schwartz描述了一个未来，内窥镜AI、宏转录组学和组织病理学相结合，创造出全新的疾病模型和表型。
- "如果我发现了结肠癌，我们已经错过了最佳时机。"
Parikh博士认为，最大的机会不是更早发现癌症，而是识别出完全先于癌症形成的生物功能障碍。
- 微生物组检测会成为常规胃肠病护理的一部分吗？
专家组讨论了工作流程、报销和采用挑战，这些将决定到2030年微生物组检测是否会成为主流。
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