背景:尽管遗传学研究已分别聚焦于冠状动脉疾病(CAD)和认知障碍(IC),但理解IC与CAD共病(ICAD)的遗传结构,能为基于共享基因的临床病理生理学提供洞见。
方法:我们对AllofUS(AoU)参与者(年龄≥60岁)中患有ICAD的个体进行了常见变异全外显子组关联分析(ExWAS,次要等位基因频率≥1%),并与CAD和IC患者进行比较。我们将CAD定义为有心绞痛/缺血性心脏病史或接受过冠状动脉血运重建,将IC定义为轻度认知障碍/全因痴呆或记忆障碍(基于ICD/SNOMED编码)。我们进一步根据自身ExWAS结果和既往遗传学研究,整理了一份与IC相关的SNV(n=230)和与CAD相关的SNV(n=420)列表,通过全表型组关联分析(PheWAS)比较IC和CAD SNV之间的共享特征。ExWAS和PheWAS分别采用Bonferroni校正后的显著性阈值p<2.7×10⁻⁷和p<1.5×10⁻⁵,以及提示性阈值p<10⁻⁴和p<2.9×10⁻⁵。
结果:我们发现rs429358(APOE,OR:1.35 (1.27-1.45),p=7.1×10⁻²¹)、rs11556505(TOMM40,OR:1.24 (1.16-1.33),p=3.34×10⁻¹⁰)、rs6857(NECTIN2,OR:1.27 (1.19-1.35),p=1.3×10⁻¹²)和rs112502960(ZNF652,新发现,OR:1.16 (1.10-1.22),p=9.5×10⁻⁸)与ICAD显著相关。在IC和CAD SNV的共享特征中,我们发现了与APOE/APOC1/NECTIN2/ABCA1位点相关的冠状动脉粥样硬化和高脂血症;与LAMB2/TSPAN14/ZNF652位点相关的高血压;以及与TREML2/TMEM106B位点相关的传导缺陷。
解释:在具有多样性的AoU参与者中,我们鉴定出多个与ICAD显著相关的位点。通过PheWAS,我们识别出许多由IC和CAD SNV共享的心血管代谢特征(冠状动脉粥样硬化、高血压、传导缺陷和高脂血症)。
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