代谢组学是对细胞、生物流体、组织或生物体内小分子（代谢物）的全面研究。这些代谢物是细胞过程的最终产物，其分析可以提供生物系统生理状态的快照。生物技术公司利用代谢组学正在推进有希望的候选药物。通过分析代谢物，研究人员可以发现疾病的新生物标志物，了解疾病机制，并监测治疗反应。这种方法加速了潜在药物靶点的识别，有助于在开发过程中评估药物的有效性和毒性。虽然代谢组学在诊断应用中发挥了重要作用，但其影响已扩展到治疗开发。通过阐明与疾病相关的代谢变化，代谢组学使设计针对性干预成为可能，从而提高新治疗方法的精确性和有效性。越来越多的生物技术公司现在将代谢组学整合到他们的药物开发过程中。本文将介绍七家利用代谢组学洞察力的公司。
1. Akero Therapeutics
- 疾病领域：代谢功能障碍相关脂肪性肝炎（MASH）
- 候选药物：EFX
- 最新消息：公布积极的二期临床数据
Akero Therapeutics成立于2017年，是一家位于加利福尼亚州南旧金山的临床阶段生物技术公司。该公司致力于开发治疗严重代谢疾病的药物，主要关注代谢功能障碍相关脂肪性肝炎（MASH）。Akero的主要候选药物Efruxifermin（EFX）是一种Fc-FGF21融合蛋白，旨在模仿内源性成纤维细胞生长因子21（FGF21）的平衡生物活性。FGF21是一种天然激素，可减轻细胞应激，并在调节脂质和葡萄糖代谢、能量消耗和胰岛素敏感性方面发挥关键作用。Akero利用代谢组学来理解FGF21在代谢调节中的作用，并指导EFX的开发。EFX目前正在多个三期临床试验中进行评估，用于治疗MASH。最近的二期b期研究数据显示，接受EFX治疗的患者中有39%的肝硬化逆转而MASH未恶化，而安慰剂组这一比例为15%。
2. Holoclara
- 疾病领域：过敏性和自身免疫性疾病
- 候选药物：HC002
- 最新消息：启动HC002的一期临床试验
Holoclara总部位于加利福尼亚州帕萨迪纳，致力于开发源自寄生虫的疗法，以治疗过敏性和自身免疫性疾病。该公司的方法基于肠道线虫分泌的免疫调节分子的发现，这些分子与人类共同进化，具有天然的免疫调节特性。Holoclara利用代谢组学分析治疗用寄生虫物种的分泌物，绘制其对已知驱动过敏性和自身免疫性疾病的各种免疫细胞的个体效应图谱。这种方法使得识别和表征具有潜在治疗应用的生物活性小分子成为可能。Holoclara的主要候选药物HC002是一种口服可用的小分子，源自寄生虫分泌物。2024年12月，该公司在澳大利亚启动了一项一期临床试验，以评估HC002在健康成年人中的安全性、耐受性和药代动力学，结果预计于2025年公布。公司选择嗜酸性食管炎（EoE）作为HC002的主要适应症。EoE是一种慢性炎症性疾病，特征是食管中嗜酸性粒细胞水平升高，导致吞咽困难、胸腹痛、呕吐和食欲减退等症状。
3. MAX BioPharma
- 疾病领域：特发性肺纤维化（IPF）、非酒精性脂肪性肝炎（NASH）、慢性炎症
- 候选药物：Oxy210
- 最新消息：与Metaba合作
MAX BioPharma成立于2010年12月，是一家位于加利福尼亚的临床前阶段生物制药公司，专注于开发新型小分子脂质，特别是氧甾醇。MAX BioPharma开发的氧甾醇药物适用于多种疾病，如非酒精性脂肪性肝炎（NASH）、特发性肺纤维化（IPF）和慢性炎症。其主要候选药物Oxy210抑制两种促纤维化信号通路：Hedgehog（Hh）和转化生长因子-β（TGF-β）。此外，它还通过抑制Toll样受体2（TLR2）和TLR4表现出抗炎活性。临床前研究表明，Oxy210在小鼠模型中有效改善了肝纤维化、炎症和高胆固醇血症，表明其可能成为治疗NASH、动脉粥样硬化和其他与代谢紊乱相关的慢性炎症性疾病的治疗候选药物。2024年2月，MAX BioPharma宣布与Metaba合作，研究氧甾醇药物候选物对代谢过程的影响。利用Metaba的代谢组学平台技术，该合作旨在识别由氧甾醇诱导的代谢物变化。这项合作不仅加深了对其药物机制的理解，还将识别用于评估药物疗效的潜在生物标志物。
4. Seres Therapeutics
- 疾病领域：微生物组疗法
- 候选药物：SER-109
- 最新消息：SER-109获FDA批准
Seres Therapeutics成立于2010年，总部位于马萨诸塞州剑桥市，是一家微生物组疗法公司，开发新型多功能细菌联合体，旨在与宿主细胞和组织相互作用以治疗疾病。其疗法由经过优化的特定细菌组成，具有感染预防、上皮屏障完整性的恢复和免疫调节等药理特性。Seres利用代谢组学来理解其微生物组疗法对宿主代谢的功能影响。通过分析其细菌联合体诱导的代谢变化，该公司旨在阐明作用机制，识别治疗效力的生物标志物，并优化其药物候选物。Seres的主要候选药物SER-109是一种口服微生物组疗法，由高度纯化的厚壁菌门孢子组成，旨在通过调节失调的微生物组以抵抗艰难梭菌的定植和生长，从而预防复发性艰难梭菌感染（rCDI）。艰难梭菌是一种细菌，常因抗生素使用破坏肠道微生物组并产生毒素引起严重的腹泻和结肠炎。SER-109于2023年获得美国食品药品监督管理局（FDA）批准。另一款值得注意的候选药物是SER-155，这是一种口服活体生物疗法，旨在消除胃肠道病原体，改善上皮屏障完整性，并调节免疫反应，以防止异基因造血干细胞移植患者的细菌血流感染和其他并发症。Seres还在推进针对慢性肝病和溃疡性结肠炎的两个临床前项目。
5. Siolta Therapeutics
- 疾病领域：特应性疾病
- 候选药物：STMC-103H
- 最新消息：获得1200万美元C轮融资
Siolta Therapeutics成立于2016年，总部位于加利福尼亚州圣卡洛斯，开发活体生物疗法产品（LBPs）和分子诊断工具。该公司的研究集中在“母-婴轴”，解决特应性疾病、女性健康问题和罕见儿科适应症。Siolta利用代谢组学来理解肠道微生物活动与人类健康之间的关系。通过分析微生物组产生的代谢物，公司获得了微生物群落对人体生理功能贡献的见解。这种方法不仅有助于描述一般现象，还能通过靶向代谢物分析揭示具体的作用机制，从而为药物开发过程提供信息。Siolta的主要候选药物STMC-103H是一种多菌株活体生物疗法，目前正在进行二期临床试验，以预防包括特应性皮炎、食物过敏和哮喘在内的特应性疾病。2024年3月，Siolta Therapeutics在C轮融资中筹集了1200万美元，以推进其主要项目的临床开发。
6. Sinopia Biosciences
- 疾病领域：帕金森病
- 候选药物：SB-0110
- 最新消息：2024年获得两项SBIR资助
Sinopia Biosciences利用其专有的人工智能和机器学习（AI/ML）药物发现平台，在神经学、肿瘤学和遗传疾病领域识别新型治疗药物。该公司的平台整合了高通量多组学数据，包括代谢组学，以发现独特的治疗机会。通过分析大规模代谢组学数据集，公司识别出新的药物靶点和治疗候选物。SB-0110是Sinopia的主要候选药物，是一种首创的小分子，旨在治疗帕金森病和左旋多巴诱导的异动症（LID）。SB-0110在临床前模型中表现出显著疗效，目前正在推进临床试验申请（IND）支持研究，计划于2025年初启动一期a/b临床试验。2024年5月，Sinopia从国家普通医学科学研究所获得了小型企业创新研究（SBIR）资助，以推进其LEarn And DiScover（LEADS）平台，并探索肿瘤学和免疫学的应用。这笔资金支持公司开发新算法以分析专有代谢组学数据集，并探索新的治疗领域。2024年晚些时候，Sinopia还从国家牙科和颅面研究所以及口腔黏膜炎项目获得了另一项SBIR资助。
7. STALICLA
- 疾病领域：自闭症谱系障碍
- 候选药物：STP1
- 最新消息：获得1740万美元B轮融资
STALICLA总部位于瑞士日内瓦，专注于为患有神经发育障碍（NDD）的患者开发精准医学疗法，最初重点关注自闭症谱系障碍（ASD）。该公司的使命是识别具有临床可行性的患者亚群，并开发针对这些人群需求的定制治疗方案。STALICLA开发了基于数据库的内表型患者识别（DEPI）平台，这是一项AI驱动且临床验证的技术，整合了全面的代谢组学、全基因组测序、RNA测序和高级计算分析。该平台能够识别具有相似疾病特征的患者亚群，从而将这些亚群与靶向药物候选物配对。STALICLA的主要候选药物STP1是为通过DEPI平台识别的特定ASD患者亚群设计的。公司已完成STP1的一期b期临床试验，证明了其安全性和耐受性。2022年，STALICLA从诺华获得了mavoglurant的授权，这是一种代谢型谷氨酸受体5（mGluR5）负变构调节剂。该药物最初用于脆性X综合征，现作为STP-7推进治疗可卡因使用障碍的研究，2024年与美国国家药物滥用研究所（NIDA）合作启动了三期临床试验。STALICLA在2024年初完成了1740万美元的B轮融资。
(全文结束)
