麻省理工学院和哈佛大学的布罗德研究所正在与Manifold合作,将其独特的生活科学研究和开发平台推向世界各地的研究人员。
随着医疗数据量的增加并分散存储在多个云端服务提供商中,布罗德研究所将开始使用Manifold的AI平台,通过其云无关架构来解决这一问题。Manifold和布罗德将共同调整现有平台,以推进研究所内外的基因组研究。
布罗德研究所是一个先锋研究实验室,成立于2004年,当时哈佛大学和麻省理工学院的研究人员汇聚一堂,目标是通过合作推进基因组研究。
“我们意识到,某些类型的研究项目对于催化整个生态系统中的生物医学研究进展至关重要,但在典型的学术实验室中很难完成这些项目。”布罗德研究所主任Todd Golub在接受采访时说。
Manifold由现任首席执行官Vinay Seth Mohta于2016年共同创立,最初是一家在医疗研究中应用AI的咨询公司。2021年,Manifold开始构建其R&D平台,为研究机构带来无需编码的软件。
“我们从癌症研究开始,因为看到癌症不断推动科学和技术的发展,同时也推动了数据的发展,这是我们在其中看到很多痛点的地方。”Mohta说。
Manifold已经在美国癌症协会(ACS)和印第安纳大学梅尔文和布伦·西蒙综合癌症中心部署了其研发平台。
“与布罗德研究所合作,我们非常兴奋能够带来一些基于其用例的新型基因组相关能力,这些用例将在大约三年内成为大家的用例。”Mohta说,“因为这就是布罗德研究所所做的。他们在科学领域处于领先地位。”
布罗德研究所二十年来的经验教训将被纳入Manifold平台。现有的布罗德软件的一个关键转折点是,研究人员无需了解如何编写代码即可使用该平台。该组织特别计划将其用于生物信息学管道。
Mohta表示,他们计划每季度添加新功能,使更多研究人员能够加入平台,并与布罗德研究所与其他机构(如公司或其他研究机构)的合作一起推进。
“通过更现代化的技术架构,确实可以更好地启用AI,这将再次推动未来发现的可能性,当我们考虑我们可以用这些数据做什么时。”布罗德研究所数据科学平台联合负责人Heather Jankins说。
也许新平台最令人兴奋的功能之一是其“自带云”功能。根据Manifold的说法,“自带云”意味着平台用户可以无缝使用现有的云服务提供商来支持Manifold研究平台。
“科学发生在所有云上,因此我们希望确保我们能够最大限度地促进科学发展。”Jankins说,“从这个角度来看,拥有一个天生具有云无关选择的平台对我们来说非常激动人心,这样我们就可以真正利用数据,无论数据存储在哪里。”
研究机构使用各种不同的云提供商,如Google、Amazon Web Services和Microsoft。如果没有“自带云”功能,研究人员可能不得不考虑将数据迁移到另一个云端以与特定研究平台兼容,或选择不使用该平台。
“现在有两个事情正在发生,一个是生成的数据量爆炸式增长,另一个是AI的力量使得每个人都可以对大型数据集提出复杂的问题,无论它们是在哪里生成的。”Golub说,“这与过去的研究方式截然不同,过去你只能在自己的实验室进行实验并分析结果。”
Golub继续说道:“我们仍然处于数据生成、数据聚合和复杂数据分析的早期阶段。我们需要考虑这项活动的未来,以及下一阶段所需的条件,鉴于数据量的持续增长和需求,这就是布罗德-曼尼福尔德合作的动机。”
对布罗德研究所而言,Manifold创建了一个受信任的研究环境也非常重要,在这种环境中,只有授权用户可以在有限的时间内访问患者的基因组数据。
Manifold的当前客户之一是美国癌症协会(ACS),该协会正在进行几项涉及150万参与者的癌症研究。借助Manifold,ACS允许外部研究机构使用其数据,同时确保数据的安全访问。
“这项工作的目的是加快世界做出重要发现的步伐,以帮助患者,如果没有真正可扩展、持久且强大的数据平台,这一过程不会像预期那样迅速,因此我们很高兴能够实现这一点。”Golub说。
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