通过连续精子样本直接测量个体男性生殖系突变率Direct measurement of the male germline mutation rate in individuals using sequential sperm samples

环球医讯 / 健康研究来源:www.nature.com美国 - 英语2025-08-25 10:14:42 - 阅读时长2分钟 - 780字
本研究通过对比23名精子捐献者间隔10-33年的连续精子样本,利用高保真双端测序技术首次实现了个体层面生殖系突变率的直接测量。研究发现每位受试者的精子突变负荷随年龄显著增长,但克隆性突变的嵌合水平在多年间保持稳定,为理解男性生殖细胞突变累积机制提供了新见解。
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通过连续精子样本直接测量个体男性生殖系突变率

本研究开发了独特的研究设计,通过召回23名曾冷冻保存精子样本的捐献者获取新样本,实现了个体层面生殖系突变率的直接测量。新旧样本间隔时间跨度达10-33年,采用高保真双端测序技术对这些样本进行分析,结果显示群体层面突变率与三体组学研究一致,但首次证实每位受试者的精子突变负担在两次采样期间均显著增加。

关键发现

年龄相关突变累积

  • 精子嵌合突变负荷随年龄呈线性增长
  • 单核苷酸替代突变率为5.74×10^-10/年(95%CI:4.92-6.55×10^-10)
  • 插入缺失突变率为2.59×10^-11/年
  • 突变图谱与三体组学研究高度一致(余弦相似度0.97)

个体特异性分析

  • 23名受试者中22人检测到突变负荷增加
  • 中位突变率为5.3×10^-10/年
  • 1例隐睾症患者显示异常高突变率(1.48×10^-9)

克隆性突变研究

通过深度全基因组测序分析两个个体的连续样本,发现:

  • 克隆突变数量随年龄保持稳定
  • SPM-1564个体携带致病性TSC2突变(p.Q90X)
  • 早期发育突变的嵌合水平多年保持稳定(Δ绝对值变化<1%)

方法创新

样本获取

利用冷冻精子库的长期保存样本,突破了组织样本长期跟踪的伦理和技术限制。研究包含:

  • 23名捐献者(平均间隔15.9年)
  • 同时采集血液/唾液样本作为对照

技术突破

  • 结合双端测序(NanoSeq)与深度全基因组测序(318×覆盖度)
  • 开发靶向双端测序验证方法,实现突变检出率提升
  • 建立NanoSeqTools分析工具包

临床意义

研究证实:

  • 精子突变率个体差异显著(90%分位与10%分位比值2.9)
  • 隐睾症等生育相关疾病可能影响突变率
  • 未来可用于评估新生儿遗传病风险,指导遗传咨询

局限性

  • 测序成本限制样本量
  • 未检测<1%频率的克隆突变
  • 需更大规模队列验证个体间变异

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