CALERIE基因组数据资源The CALERIE Genomic Data Resource

环球医讯 / 干细胞与抗衰老来源:www.nature.com美国 - 英语2024-12-13 18:00:00 - 阅读时长3分钟 - 1478字
本文介绍了CALERIE随机对照试验中生成的基因组数据资源,这些数据包括全基因组单核苷酸多态性基因型、DNA甲基化、mRNA和小RNA数据集,涵盖血液、骨骼肌和脂肪组织样本,旨在深入了解热量限制对人体生物衰老的影响。
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CALERIE基因组数据资源

热量限制(CR)可以减缓模式生物的生物学衰老过程并延长其健康寿命。CALERIE随机对照试验的结果广泛支持热量限制在健康、非肥胖人群中具有类似效果。为了进一步了解热量限制在人体中的分子途径和生物学过程,我们从试验期间收集的218名参与者的生物标本中生成了一系列基因组数据集。这些数据构成了一个针对衰老生物学干预的随机对照试验的基因组数据资源。数据集包括全基因组单核苷酸多态性基因型,以及从血液、骨骼肌和脂肪组织样本中生成的三个时间点的纵向DNA甲基化、mRNA和小RNA数据集(总样本量为2,327)。本文描述的CALERIE基因组数据资源可从老龄化研究生物库获取。这一多组织、多组学、纵向数据资源在推动转化老年科学方面具有巨大潜力。ClinicalTrials.gov注册号:NCT00427193。

数据可用性

处理后的数据可通过老龄化研究生物库(

代码可用性

用于生成汇总数据和图表的代码可在Dryad上通过

参考文献

  1. Bales, C. W. & Kraus, W. E. 热量限制:对人类心血管代谢健康的影响. J. Cardiopulm. Rehabil. Prev. 33, 201–208 (2013).
  2. Speakman, J. R. & Mitchell, S. E. 热量限制. Mol. Aspect. Med. 32, 159–221 (2011).
  3. Fontana, L., Meyer, T. E., Klein, S. & Holloszy, J. O. 长期热量限制在降低人类动脉粥样硬化风险方面非常有效. Proc. Natl Acad. Sci. USA 101, 6659–6663 (2004).
  4. Meyer, T. E. 等. 长期热量限制可改善人类的舒张功能下降. J. Am. Coll. Cardiol. 47, 398–402 (2006).
  5. Heilbronn, L. K. 等. 6个月热量限制对超重个体长寿生物标志物、代谢适应和氧化应激的影响:一项随机对照试验. JAMA 295, 1539–1548 (2006).
  6. Walford, R. L., Harris, S. B. & Gunion, M. W. 生物圈2号中低热量低脂高营养密度饮食显著降低了人类的血糖、总白细胞计数、胆固醇和血压. Proc. Natl Acad. Sci. USA 89, 11533–11537 (1992).
  7. Flanagan, E. W., Most, J., Mey, J. T. & Redman, L. M. 人类中的热量限制和衰老. Annu. Rev. Nutr. 40, 105–133 (2020).
  8. Ravussin, E. 等. 为期2年的随机对照试验评估人类热量限制的效果:可行性和对健康跨度和长寿预测因子的影响. J. Gerontol. Series A 70, 1097–1104 (2015).
  9. Kraus, W. E. 等. 2年的热量限制和心血管代谢风险(CALERIE):多中心、第2阶段随机对照试验的探索性结果. Lancet Diabetes Endocrinol. 7, 673–683 (2019).
  10. Belsky, D. W. 等. 对热量限制反应的生物老化速率变化:CALERIE生物银行分析. J. Gerontol. A Biol. Sci. Med. Sci. 73, 4–10 (2018).


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