根据发表在《美国呼吸与重症监护医学杂志》上的一项研究，肠道微生物群组成与特发性肺纤维化(IPF)的疾病严重程度和无移植生存期相关。
作者写道："在探索性事后分析中，肠道微生物群与IPF患者的疾病严重程度、治疗异质性以及无移植生存期相关。"
CleanUP-IPF试验(NCT02759120)是一项由美国国家心肺血液研究所资助的多中心随机对照试验，评估了长期广谱抗菌治疗在IPF患者中的疗效。具体而言，该研究比较了多西环素或复方新诺明与标准常规治疗的使用效果。
由于抗生素对肠道微生物群落的影响已被记录在案，且越来越多的证据表明微生物组与全身免疫调节相关联，这为试验提供了机会，可以在此人群中研究微生物组与治疗的相互作用。
研究人员进行了一项探索性事后分析。他们使用16S核糖体RNA基因扩增子测序对来自411名CleanUP-IPF参与者的基线粪便样本进行了肠道微生物群表征，并在41名参与者的试点子集中补充了鸟枪法宏基因组测序。
研究团队使用主成分分析、多元广义线性模型和Cox回归模型评估了基线微生物群与疾病严重程度、12个月无移植生存期(TFS)以及治疗异质性之间的关联，这些模型针对年龄、性别、吸烟史、基线肺功能以及抗纤维化药物和质子泵抑制剂的使用进行了调整。
肠道微生物多样性及群落组成与气体交换受损(一氧化碳弥散能力的预测百分比)显著相关，但与用力肺活量的预测百分比无关，这支持了疾病较轻与肠道微生物多样性较高的关联。
在所检查的属中，未分类的毛螺菌科(Lachnospiraceae)表现出最具临床意义。
在常规护理组中，未分类毛螺菌科丰度较高的患者比丰度较低的患者具有更长的无移植生存期。与使用尼达尼布的患者相比，使用吡非尼酮的患者中，该菌属丰度较高的生存获益进一步放大，这表明抗纤维化药物疗效与肠道微生物群组成之间可能存在相互作用。
此外，被分配接受复方新诺明且未分类毛螺菌科丰度较高的患者，其12个月无移植生存期明显比接受常规护理或多西环素的患者更差。
在未分类毛螺菌科丰度中等或较低的患者中，研究人员未观察到抗生素组之间在生存方面有任何显著差异。
作者提出，复方新诺明可能会消耗肠道中的毛螺菌科，从而减少具有保护作用的免疫调节信号，对肺部炎症和纤维化产生下游影响，并可能解释了在CleanUP-IPF和EME-TIPAC试验中观察到的复方新诺明无益处的现象。
肠道微生物组通过产生短链脂肪酸、次级胆汁酸和其他免疫调节代谢物，是全身免疫的关键调节者。临床前研究表明，肠道微生物群落通过肠-肺轴参与肺部免疫和纤维化，但此前尚无大规模人体研究检验肠道微生物组与IPF临床结局之间的关联。
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