其他特指的3号染色体缺失Other specified Deletions of chromosome 3
编码LD44.3Y
关键词
索引词Deletions of chromosome 3、其他特指的3号染色体缺失
缩写3号染色体缺失、3-染色体缺失
别名3p-综合征、3q29-微缺失-综合征、3-染色体部分缺失
其他特指的3号染色体缺失（LD44.3Y）诊断标准、辅助检查及实验室参考值
一、诊断标准
-
金标准：
- 染色体微阵列分析（CMA）或荧光原位杂交（FISH）：
- 检测到3号染色体上明确界定的特定区域缺失（如3p25.3-pter缺失或3q29微缺失等），且不属于已命名缺失综合征（如3p缺失综合征、3q29微缺失综合征）。
- 染色体微阵列分析（CMA）或荧光原位杂交（FISH）：
-
必须条件：
- 基因检测阳性：
- 通过高分辨率染色体核型分析（≥550条带）或基因组检测技术（如aCGH、CNV-seq）确认3号染色体存在≥5 Mb的非随机性缺失。
- 核心临床表现组合（需满足至少两项）：
- 智力障碍（IQ＜70）或发育迟缓（发育商＜85）。
- 典型颅面特征（眼距宽、低鼻梁、小下颌）。
- 先天性心脏病（室间隔缺损/房间隔缺损）。
- 基因检测阳性：
-
支持条件：
- 次要临床表现（满足两项及以上可增强诊断信心）：
- 生长迟缓（身高/体重＜3rd百分位）。
- 脑结构异常（脑室扩大、胼胝体发育不良）。
- 骨骼畸形（脊柱侧弯、手指畸形）。
- 家族史：
- 父母一方携带染色体平衡性重排（需通过父母核型分析验证）。
- 次要临床表现（满足两项及以上可增强诊断信心）：
二、辅助检查
检查项目树：
┌── 一级检查（确诊层）
│ ├── 染色体微阵列分析（CMA）
│ └── 全基因组测序（WGS）
├── 二级检查（表型评估层）
│ ├── 心脏超声
│ ├── 脑部MRI
│ └── 肾脏超声
└── 三级检查（功能评估层）
├── 神经发育评估（Griffiths量表）
└── 代谢筛查（血/尿代谢组学）
判断逻辑：
-
染色体微阵列分析：
- 分辨率达50 kb以上，可检测≥200 kb的缺失片段。
- 发现3号染色体缺失后需排除全基因组拷贝数变异（如染色体非整倍体）。
-
心脏超声：
- 优先排查室间隔缺损（VSD）和肺动脉狭窄，阳性结果需与22q11.2缺失综合征鉴别。
-
脑部MRI：
- 发现胼胝体发育不良时，需扩展检测 SOX2 基因（位于3q26.33）缺失情况。
三、实验室参考值及异常意义
| 检测项目 | 正常参考值 | 异常意义 |
|---|---|---|
| 染色体核型分析 | 46,XX/XY | 发现3号染色体结构异常（如del(3)(p25)）即可确诊 |
| CMA缺失片段大小 | 无拷贝数变异 | ≥5 Mb缺失具有临床意义，需结合表型判断致病性 |
| 血清氨基酸谱 | 各氨基酸浓度在±2SD内 | 检测到脯氨酸/谷氨酰胺异常提示 PRODH 基因（3p21.3）可能受累 |
| 尿有机酸分析 | 无异常代谢产物 | 甲基丙二酸升高提示 MMAA 基因（3q21.3）功能缺失 |
| 神经发育评估 | 发育商≥85 | 发育商＜70需启动早期干预，提示 ZIC1（3q24）等神经发育基因可能缺失 |
四、总结
- 诊断核心：基因检测（CMA/WGS）发现明确致病性缺失是确诊依据。
- 表型关联：需重点评估神经发育、心血管及骨骼系统异常。
- 鉴别要点：需排除3p/3q经典缺失综合征及其他染色体微缺失疾病（如22q11.2缺失）。
参考文献：
- 《临床细胞遗传学技术标准》（ACMG 2023）
- Miller DT, et al. Genet Med 2010;12(11):742-745（3q29微缺失诊断共识）
- OMIM数据库：#613792（3p25缺失综合征）